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野菊花its2基因序列分析及鉴定研究【字数:6538】

2024-02-24 17:40编辑: www.jxszl.com景先生毕设
通过DNA条形码鉴定技术快速、准确鉴别野菊及其近缘种(易混品)。采用试剂盒法提取野菊花基原植物野菊及其近缘种(易混品)的基因组DNA,应用通用引物扩增其核ITS2基因序列并进行双向测序。应用MEGA 5.0软件对测序获得的序列进行纠错比对,分析ITS2序列的特征,并计算物种的种内、种间Kimura 2-Parameter(K2P)遗传距离,采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统聚类树。野菊ITS2序列长度为221 bp,存在3个变异位点,分别为种间一个和种内两个;从构建的NJ树反映出野菊与菊属其他物种距离较近,与菊科其他属之间遗传距离较远。NJ树显示ITS2序列作为常用的DNA条形码对菊属中与野菊密切相关的植物鉴定能力不够,但对菊科其他属植物具有较好的区分效果。ITS2序列的研究为今后野菊及其近缘种(易混品)的分子鉴定研究提供数据基础和借鉴。
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract 1
Key Words 1
1 材料与方法 2
1.1植物材料 2
1.2仪器与试剂 4
1.3方法 4
1.3.1 DNA提取 4
1.3.2 DNA样品浓度和纯度检测 4
1.3.3 PCR扩增 4
1.3.4 PCR产物浓度和纯度检测 5
1.4 PCR产物测序及序列数据处理 5
2结果与分析 5
2.1样品DNA的提取及浓度和纯度检测 5
2.2 PCR扩增及产物浓度和纯度检测 6
2.3测序结果及ITS2序列特征 7
2.4野菊及其混伪品种内及种间遗传距离分析 9
2.5构建NJ树 9
3讨论 11
3.1野菊能成功获得高质量ITS2序列 11
3.2 ITS2条形码是准确鉴定药材的有效手段 11
致谢 11
参考文献: 12
野菊花ITS2基因序列分析及鉴定研究

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