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干扰素γ基因的鉴定分析

2021-04-01 12:55编辑: www.jxszl.com景先生毕设
基于前期RNA测序结果,筛选出了重要差异表达基因猪干扰素γ。干扰素(IFN)是动物机体受到病毒入侵时由细胞所合成并分泌的一种具有生物活性的物质,在抗细菌、抗病毒、抗肿瘤以及免疫调节等方面扮演着重要角色;为进一步研究猪干扰素γ(IFN-γ)在猪免疫应答反应的重要影响,本研究初步采用PCR扩增及直接测序技术检测到猪IFN-γ基因外显子4区域一个SNP(g.5330, T>C),经蛋白质预测该SNP为错义突变,由异亮氨酸变为苏氨酸,这为下一步在群体内探讨此SNP位点与血清干扰素γ浓度的相关性奠定了基础。
目录
摘要 1
关键词 1
Abstract. 1
Key words 1
引言 1
1 材料与方法 2
1.1 实验材料 2
1.1.1 实验动物 2
1.1.2 实验用品和主要试剂 2
1.1.3 实验仪器 3
1.2 常规溶液及试剂配制 3
1.3 试验方法及步骤 3
1.3.1 引物合成 3
1.3.2 基因组的提取 4
1.3.3 基因组的检测 4
1.3.4 PCR扩增 4
1.3.5 琼脂糖凝胶电泳 4
1.3.6 PCR产物测序 5
2 结果与分析 5
2.1 基因组检测结果 5
2.2 PCR扩增结果 6
2.2.1 不同引物的梯度PCR检测 6
2.2.2 不同引物的PCR扩增结果 6
2.3 猪干扰素γ基因多态性检测 7
2.4 实验结论 8
3 讨论 8
致谢 9
参考文献: 10
干扰素γ的鉴定分析
引言
干扰素是动物机体中最重要的细胞因子之一,其主要生物学功能体现为广谱的抗病毒功能和强大的机体免疫调节功能。于1857年由英国科学家Alick Isaacs和瑞士研究人员Jean Lindenmann利用鸡胚的绒毛尿囊研究对流感病毒的干扰作用时发现。由于这种新发现的糖蛋白能够干扰病毒在机体内的繁殖,且具 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: ¥351916072¥ 
有高度的生物学活性,因此将其命名为干扰素(Interferon, IFN)[1]。根据基因和蛋白结构以及功能特征的差异,干扰素在哺乳动物中又被划分为三大类:I型、II型和III型干扰素。其中I型干扰素主要包含IFNα,IFNβ,IFNτ,IFNω等,其基因结构中不存在内含子,主要在机体早期抵抗病毒的感染发挥重要的作用;II型干扰素只包含一种类型:IFNγ,其基因结构含有内含子,主要在机体获得性免疫反应中发挥重要的作用;III型干扰素包含IFNλ,它与I型干扰素在基因结构和功能上非常相似,在基因结构中也不含有内含子[2]。正因为干扰素在机体中发挥非常重要的作用,近几十年来,关于干扰素的研究一直是细胞学、病毒学以及分子生物学等相关领域热点课题;同时,干扰素的调控机理也成为研究热点。
干扰素γ是由在机体发挥免疫作用的免疫细胞分泌而产生,主要在免疫反应的后期阶段发挥重要的功能[3];干扰素γ主要由活化的T淋巴细胞和自然杀伤细胞(NK细胞)合成分泌,是一种具有多种功能的细胞因子。猪干扰素γ基因序列全长约为5568bp,编码由166个氨基酸残基组成的前体蛋白。它由4个外显子和3个内含子构成,其中第1外显子编码5′端的非编码区(UTR)和信号肽以及成熟肽的部分氨基酸;第2外显子和第3外显子编码成熟肽的部分氨基酸;第4外显子编码包含终止密码子的部分氨基酸以及及3′端非编码区(UTR)。干扰素γ基因的开放阅读框(ORF)序列全长约为501bp,其中信号肽为23个氨基酸,其功能是引导IFNγ分泌到细胞外,在细胞外将信号肽切去之后便成为成熟的IFNγ。它总共包含有143个氨基酸,其分子量为17KD[4]。在现在规模化的养猪生产过程中,生产性状与对疾病的抗性性状之间存在着一定程度上的遗传拮抗作用,表现为一定的负遗传相关,如果单纯追求高产通常会导致猪只对疾病的抵抗性降低,同时猪场中的各种疾病,特别是病毒性的传染病,会严重威胁到猪只的健康。尽管疫苗预防接种发挥了重要的疾病防治作用,但是却不能完全控制和消灭传染病的流行。从更长远的利益来看,利用分子遗传学的方法从遗传本质上来提高猪只对病原的抵抗力,开展抗病育种工作是最根本的解决方法。因此,以猪IFNγ基因作为免疫抗性相关的候选基因进行相关的研究,探索其在免疫应答机制中的关键作用,同时筛选出与抗性性状相关的分子遗传标记,应用于标记辅助选择,对培育具有抗性的猪新品系具有十分重要的科学意义。
1 实验材料与方法
1.1 实验材料
1.1.1实验动物
猪群来自中国农业科学院北京畜牧兽医研究所猪试验场,包括158头大白猪仔猪;74头松辽黑猪仔猪,共计232头。所有实验用仔猪均在相同且稳定的室内条件下饲养,并于21日龄注射猪瘟疫苗(猪瘟兔化弱毒牛体反应冻干疫苗,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所研制1份/头)。在20日龄及35日龄分别采血,并采集所有样本猪的耳部组织以提取DNA。样品现场液氮保存,然后转移至80℃低温冰箱保存。用酚氯仿抽提法提取耳组织基因组DNA,20℃保存于冰箱中备用。
1.1.2实验用品和主要试剂
材料
规格
公司
离心管
1.5ml
赛业生物科技(苏州)有限公司
PCR管
0.2ml
赛业生物科技(苏州)有限公司
双面离心管架
64孔
赛业生物科技(苏州)有限公司
DNA Marker
DL2000
宝日医生物技术(北京)有限公司

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