猪inha基因chr15121582003位点与猪产仔数的关联性分析【字数:7558】
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法3
1.1试验材料 3
1.1.1样品采集3
1.1.2 DNA提取3
1.2试验方法 3
1.2.1试剂盒提取DNA3
1.2.2目标位点引物的设计4
1.2.3目的片段PCR扩增条件的摸索4
1.2.4目的片段PCR扩增4
1.2.5对目的片段进行DNA测序 4
1.2.6 DNA测序结果与总产仔数关联分析4
2 结果与分析5
2.1基因型分型5
2.2 chr15_121582003位点多态性分布5
2.3 chr15_121582003位点基因型与产仔数关联分析5
3讨论 6
3.1 INHA基因chr15_121582003位点对苏淮猪产仔数的影响 6
3.2影响苏淮猪产仔数的其它因素 6
3.3研究价值及下一步研究计划 7
4总结 7
致谢7
参考文献7
图1 探索chr15_121582003位点扩 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: &351916072&
增条件时PCR产物的琼脂糖凝胶电泳 图4
图2 chr15_121582003 位点三种基因型的测序图5
表1 猪INHA基因chr15_121582003位点在苏淮群体中等位基因频率5
表2 猪INHA基因chr15_121582003位点不同基因型与苏淮猪总产仔数的关联分析6
表3 猪INHA基因chr15_121582003位点不同基因型与苏淮猪产活仔数的关联分析6
猪INHA基因chr15_121582003位点与苏淮猪产仔数的关联性分析
引言
苏淮猪是在新淮猪基础上根据市场需求进一步改良的培育猪种。它兼具地方猪血缘和洋猪血统,其中大约克白猪血统占75%,淮猪血统占25%[1]。苏淮猪经产母猪产仔数约12头[2],而且其群体中产仔数变异很大,是用作猪产仔性状研究的良好素材。
衡量猪繁殖性能的主要标准包含总产仔数(total number born, TNB)、产活仔数(number born alive, NBA)、断奶窝重(Litter weaning weight, LWW)、初生重(Born weight, BW)、和初生窝重(Litter born weight, LBW)等。其中,产仔数是评判猪繁殖性能的重要指标之一[3]。选育高水平的产仔性能的母猪可以为养猪业增加经济效益,也能够进一步满足市场需求。影响母猪繁殖力的因素有很多,如母猪健康状况、饲料营养水平、精液质量、饲养管理条件等,但其中母猪自身的遗传基础还是最根本的原因[4]。然而产仔性状属于数量性状,受很多复杂基因调控,遗传力较低,用传统的选育方法难以高效达到选育目的,且耗时较长。应用分子标记选育技术和全基因组选择技术更精确,能明显缩短选育时间,达到事半功倍的效果,因此成为最新研究热点。
分子标记(Molecular Markers)的基础是DNA序列变异,是DNA水平遗传多态性的直接反映。最初的遗传标记只是基于具有典型外部形态的性状,随着生命科学及生物技术的发展,遗传标记经历了从形态学扩展到生理生化、细胞、分子等层面。相比于形态学、细胞学、生物化学等其他几种标记,DNA分子标记具有检测方法简便、快速;对隐性的性状的选择非常方便[5]。在不同发育阶段,不同组织部位的DNA均可用于标记分析等多种优点[6]。分子生物学技术不断发展,目前已有数十种DNA分子标记技术,随着科技的进步,新的分子标记还会不断涌现。分子标记辅助选择(MAS)是利用与目标性状基因型紧密连锁的分子标记,进行的目标性状基因辅助选择,MAS运用于生产以来,在各个生物领域都发挥了重要得作用,在猪育种上也得到了广泛的应用。
猪的产仔性状属于数量性状。数量性状为多基因性状,通常数量性状的决定位点是成簇地分布在染色体某一片段,称为数量性状位点(Quantitative trait locus , QTL)或多基因簇[7],因家畜的经济性状大多是数量性状,所以运用QTL的标记进行辅助选择已成为现代分子育种的一个主要领域。QTL标记信息应用在育种上有三种明显优势:首先在进行常规的个体遗传评估时,在表型和系谱信息的基础上加上与QTL紧密连锁的遗传标记信息,这种分析方法类似动物模型BLUP方法的扩展,但可使评估的精准性提高;再是因为遗传标记检测不受年龄等限制,可以在早期就进行选择,不需再进行生产性能测定,因此缩小了世代间隔;还有在二次选择时,目前所用的猪育种方式一般是在育种群中根据早期生长发育情况挑选一部分个体进行性能测定,但因大多早期生长发育状况与所需选择的目标性状相关性不高,这种选择就有很大的不确定性,若能利用与目标性状连锁的标记作为辅助选择,则可在一定程度上提高准确性,确保让最优个体进入性能测定,这样选择的精确性以及选择强度均得到提高[8]。
目前,已有研究证明RYR1基因和FSHβ基因的多态性对苏淮猪产仔数和产活仔数有显著性影响[9]。张倩[10]等研究发现AHR基因Rs339939442位点多态性与苏淮猪的产仔数和产活仔数显著性相关。已有报道视黄醇结合蛋白(RetinolBinding Proteins, RBP)基因、催乳素受体基因、雌激素受体基因等能够不同程度地对苏淮猪的繁殖性能产生影响[11~14]。但这些基因的影响能力因所研究的群体不同,表现出的结果具有群体异质性。目前,人们发现的与母猪产仔性能相关的基因有20多个,如骨桥基因 (OPN) 、褪黑素受体基因 (MR) 和HSD基因家族等,但这些基因不能解释全部的母猪产仔性状变异。
原文链接:http://www.jxszl.com/yxlw/dwyx/605125.html
最新推荐
热门阅读