目录
摘要 III
关键词 III
ABSTRACT IV
KEY WORDS IV
1 选题背景 5
2 文献综述 6
3 方案论证 8
4 过程论述 9
4.1 试验动物 9
4.2 采样方法 9
4.3 试剂及溶液的配制 9
4.3.1 主要试剂 9
4.3.2 溶液的配制 9
4.4 仪器设备 9
4.5 视频录制及行为分析 10
4.5.1 视频录制 10
4.5.2 观察视频并统计分析 10
4.5.3 每栏内攻击性最强和最弱仔猪的筛选 11
4.5.4 提取耳组织DNA 11
4.6 猪5HT1A受体基因启动子区序列生物信息学分析 11
4.6.1 获取基因序列 12
4.6.2 预测核心启动子区 12
4.6.3 预测CpG岛 12
4.6.4 预测TFBS 12
4.7 猪5HT1A受体基因启动子区序列扩增及分析 12
4.7.1 引物的设计 12
4.7.2 PCR扩增 13
4.7.3 琼脂糖凝胶电泳 13
4.7.4 序列分析 14
4.7.5 统计分析 14
5 结果分析 15
5.1 猪5HT1A受体基因启动子区生物信息学分析 15
5.1.1 猪5HT1A基因核心启动子区预测结果 15
5.1.2 猪5HT1A基因启动子区CpG岛预测结果 15
5.1.3 猪5HT1A基因启动子区TFBS预测结果 16
5.2 各栏攻击性最强和最弱猪的筛选 17
5.3 猪5HT1A受体基因启动子区探索发现的潜在SNP位点 17
5.4 可疑SNP位点与攻击行为的关联性分析 18
6 讨论和结论 20
6.1 5HT1A受体基因生物信息学预测 20
6.2 5HT1A受体基因 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: ￥351916072$ 
启动子区与猪攻击行为的关系 20
致谢 22
参考文献 23
猪5HT1A受体基因遗传多态性与混群后攻击行为的相关分析
摘要
集约化养殖中，常难以避免要对猪群进行混群，混群后猪群内的攻击行为会明显增加，强烈的攻击行为会影响猪只生长，导致体表损伤增多等不良后果。五羟色胺（5hydroxytryptamine，5HT）是一种与动物的攻击行为有关的抑制性神经递质，其主要通过与受体结合来发挥生理功能。本试验探究了猪5HT1A受体基因启动子区的基因多态性与仔猪断奶混群后攻击行为的相关。通过观察500头断奶仔猪混群后48小时内的攻击行为，筛选出各栏中攻击性最强和攻击性最弱的仔猪。采集耳组织样并提取DNA，利用PCR技术扩增猪5HT1A受体基因启动子区，测序后得到两个SNP位点并统计各点的基因型。利用卡方检验比较攻击行为强和弱组仔猪基因型频率的差异。结果发现这两个SNP位点等位基因频率在攻击性最强和最弱组的仔猪中均未呈现出显著差异（P > 0.05）。基因型以及基因单倍型与仔猪攻击行为数据的关联性分析表明，野生型的仔猪在各项行为数据上均显著高于突变型（P < 0.05），表明野生型仔猪的攻击性与突变型相比较强。
引言
4.7.4 序列分析
使用DNAMAN 8和Chromas对猪5HT1A受体基因启动子区序列进行SNP位点的筛选，并鉴定每个样本的基因型。
4.7.5 统计分析
使用Excel整理样本攻击行为数据以及各个SNP位点的基因型数据，利用IBM SPSS v20.0进行统计分析，采用单因素方差分析，对筛选出的每栏内攻击性最强和最弱的猪进行攻击行为数据分析，结果用平均值（(x ）±标准误（S）表示。通过卡方检验，对攻击性最强的仔猪和最弱的仔猪的基因型频率进行对比。
由于猪的各项攻击行为数据不呈正态分布，而呈指数分布。因此，选用SAS中的PROC GLIMMIX 模型对猪的行为数据和各个SNP位点的基因型进行结果的关联性分析。固定效应为性别、单倍型和基因型，分析混群后48 h内仔猪的各项攻击行为数据与各个SNP位点的关系，结果用(x ± S表示，若P < 0.05，则差异显著。
5 结果分析
5.1 猪5HT1A受体基因启动子区生物信息学分析
5.1.1 猪5HT1A基因核心启动子区预测结果
利用Neural Network Promoter Prediction对5HT1A受体基因进行核心启动子区的预测，得到的预测结果如下。
表 51 HTR1A 基因Neural Network Promoter Prediction启动子预测结果
Table 51 The HTR1A gene promoter prediction results of Neural Network Promoter Prediction.
起始
Start
结束
End
分数
Score
启动子序列
Promoter Sequence

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