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猪acta2基因突变对脂肪性状的相关性【字数:7768】

2024-02-25 12:03编辑: www.jxszl.com景先生毕设
为探索肌动蛋白α2(Actin alpha 2, ACTA2) 基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点对脂肪性状的影响,本试验首先根据猪的预测平均背膘厚选取体重相近的高低组混样,经过PCR扩增后,将扩增效果好的样品送去测序,发现在内含子区存在多个突变位点,最后选择g.16922G>T、g.16648A>C、g.16592G>A、g.16589G>A和g.16483G>A这5个突变位点做进一步检测。对ACTA2基因g.16922G>T、g.16648A>C、g.16592G>A、g.16589G>A和g.16483G>A位点在二花脸猪中进行了测序分型。之后分析这5个突变位点的连锁相关程度,可以发现一个单倍型块在g.16589G>A和g.16483G>A这两个位点形成。因此我们选取g.16589G>A作为标签SNP位点,与其他三个位点一起,对大群中的突变情况进行了进一步的检测。关联分析表明,ACTA2基因突变位点与预测的肩胛部背膘厚、肋骨处背膘厚、腰荐接合处背膘厚、平均背膘厚、肌内脂肪含量和背膘厚与肌内脂肪含量的比值均没有显著性关联。考虑到样本量不多,因而其突变位点是否影响猪肉的脂肪性状尚有待进一步查证。
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言(或绪论)3
1 材料与方法4
1.1 试验样品 4
1.2 试验方法 4
1.2.1 提取DNA、测量数据4
1.2.2 引物的设计与合成4
1.2.3 PCR扩增体系和程序5
1.2.4 琼脂糖电泳检测5
1.2.5 测序寻找SNP位点5
1.2.6 SNP位点的关联分析5
2 结果与分析5
2.1 ACTA2基因内含子区扩增结果5
2.2 ACTA2基因内含子区SNP位点研究6
2.3 ACTA2基因不同位点的连锁不平衡分析6
2.4 ACTA2基因基因型与脂肪性状的关联分析7
3 讨论 8
4 总结 9
致谢9
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参考文献10
图1 二花脸猪ACTA2基因PCR扩增结果6
图2 SNP位点位置测序结果示意图6
图3 突变位点的连锁不平衡分析7
表1 ACTA2基因PCR引物设计参数5
表2 PCR扩增体系5
表3 ACTA2基因型与不同性状的相关性及基因效应分析8
猪ACTA2基因突变对脂肪性状的相关性研究

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