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水稻磷稳态关键基因osspxmfs1osspx1和osphr2可变剪切的生物信息学分析【字数:9188】

2024-11-02 14:50编辑: www.jxszl.com景先生毕设

目录
摘 要 1
关键词 1
ABSTRACT 1
KEYWORD 2
1 引言与文献综述 2
1.1 Pi感应元件 2
1.1.1 感知体外Pi的水平 2
1.1.2 感知体内Pi的水平 2
1.2 磷酸盐转运蛋白 2
1.2.1 PHT家族磷酸盐转运蛋白 3
1.2.2 SPX家族磷酸盐转运蛋白 3
1.3 磷信号转导的分子机制 3
1.3.1 转录调控 3
1.3.2 转录后调控 4
1.3.3 翻译后调控 4
1.3.4 可变剪切调控 5
2 材料和方法 5
2.1 材料 6
2.2 方法 6
2.2.1 OsSPXMFS1、OsSPX1和OsPHR2可变剪切图谱 6
2.2.2 编码潜力和开放阅读框的预测 6
2.2.3 非编码区二级结构预测 6
2.2.4 IRES的预测 6
2.2.5 蛋白质结构域的预测 6
2.2.6 蛋白质互作网络、螺旋卷曲和磷酸化位点的预测 6
3 结果与分析 6
3.1 Pi影响OsSPXMFS1、OsSPX1和OsPHO2的可变剪切 7
3.2 OsSPXMFS1.2、OsSPX1.2和OsPHO2.2都具有编码潜力 8
3.3 SPXMFS1.2、SPX1.2和PHO2.2的UTR都有复杂的二级结构 9
3.4 SPXMFS1.2和PHO2.2的5’ UTR可能存在IRES 10
3.5 SPX1.2和PHO2.2失去关键的互作位点和蛋白质结构域 12
4 讨论 14
4.1 SPXMFS1.2、SPX1.2和PHO2.2的翻译效率降低 14
4.1.1 5’ UTR的复杂结构抑制SPXMFS1.2和PHO2.2的翻译 14
4.1.2 SPX1.2和PHO2.2受NMD机制调控 14
4.1.3 SPXMFS1.2 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: ¥351916072
和PHO2.2不依赖于帽结构的翻译 14
4.2 SPX1.2和PHO2.2负调控磷稳态的作用下降 15
4.3 SPXMFS1、SPX1和PHO2可变剪切变体调控磷稳态的模式 15
致谢 17
参考文献 17
水稻磷稳态关键基因OsSPXMFS1、OsSPX1和OsPHO2可变剪切的生物信息学分析
摘 要
磷是植物必需的一种大量营养元素,为了应对缺磷环境,模式植物水稻在漫长的进化过程中形成了复杂的体内磷稳态调控机制。可变剪切调控在维持水稻体内磷稳态中具有重要作用,但是具体的机制仍不清楚。为了了解可变剪切调控磷稳态的机制,我们利用生物信息学方法分析以前发现的OsSPXMFS1、OsSPX1和OsPHR2的可变剪切数据,发现在缺磷条件下,OsSPXMFS1、OsSPX1和OsPHR2可变剪切变体的翻译效率下降,截短的OsSPX1和OsPHR2蛋白质负调控磷稳态的作用也下降。我们提出了一种可变剪切调控水稻磷稳态的模式,为进一步揭示磷稳态调控机制提供启示。

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