目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言（或绪论）1
1材料与方法2
1.1材料 2
1.2方法 2
1.2.1灵芝转录因子的初步筛选2
1.2.2灵芝转录因子同源基因以及其编码蛋白的基本特性分析2
1.2.3灵芝转录因子亚细胞定位预测3
1.2.4灵芝转录因子三级结构分析3
2 结果与分析3
2.1灵芝转录因子的筛选、分类、以及基本特性分析3
2.1.1灵芝转录因子的筛选与分类3
2.1.2灵芝转录因子的基本特性分析4
2.2灵芝转录因子家族的亚细胞定位6
2.3灵芝主要转录因子家族的进化分析9
2.4灵芝转录因子的三级结构预测9
2.5总结10
3讨论 10
致谢11
参考文献12
基于基因组信息的灵芝转录因子筛选及其生物信息学分析
摘 要
灵芝，一种药用真菌，其许多重要生理过程都受到各种转录因子的调控。灵芝全基因组测序的完成让对其转录因子的透彻研究成为了可能。本次项目利用比较基因组学方法，对灵芝基因组中各个主要转录因子家族进行了筛选与分类。将已经完成结构与功能分析，收录在TRANSFAC®和FTFD数据库中的来自不同真菌物种的转录因子的全长序列，利用Blast和HMMER工具对灵芝全基因组进行分析，筛选出灵芝中各家族转录因子同源基因，并利用生物信息学工具对灵芝中转录因子的基本特性进行分析。将分析完成的灵芝转录因子进行进化树分析，以及三级结构分析，解析其进化关系以及结构域特点。在灵芝中初步发现了97个转录因子，分属于15个转录因子家族。本次实验通过比较基因组学以及生物信息学对灵芝中转录因子进行了分析，为之后对与灵芝转录因子功能分析，信号调控的研究做了基础性的工作。

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