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un2基因决定绿豆复叶发育的遗传调控网络研究【字数:5694】

2024-02-25 16:02编辑: www.jxszl.com景先生毕设
在高等植物中,KNOXI基因在植物叶片的发育过程中起到关键作用。在番茄和碎米荠等模式植物中的研究表明,KNOXI分子途径在复叶发育中起关键作用,决定复叶的小叶数目KNOXI调控叶形态发育的分子途径具有保守性。通过遗传学和分子生物学等方法,许多调控复叶发育的关键因子被鉴定出来,这些因子在转录水平调控KNOXI基因的表达或蛋白水平调控KNOXI的功能,构成KNOXI分子途径。在豆科植物基因组中,存在KNOXI和UNI两条分子途径,调控复叶发育,决定复叶的小叶数目。本次实验通过提取样品中的DNA,设计与之相应的引物,对亲本样品中提取出来的DNA先进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,筛选出差异较为清晰的两组引物,并用来对提取出来的群体的DNA进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,对比分析结果,找到调控复叶发育的基因的基本位置。
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言 3
1材料与方法5
1.1实验材料 5
1.2实验方法 5
1.2.1提取DNA5
1.2.2合成相关引物 5
1.2.3DNA聚合酶式反应(PCR)5
1.2.4聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE6
1.2.5银染6
2结果与分析6
2.1突变体表型分析7
2.2 un2和hel1之间的遗传相互作用7
2.3 SeqBSA分析和绿豆中UN2基因的精细定位8
2.4 DNA亲本浓度 8
2.5引物聚丙烯酰胺凝胶电泳结果11
3讨论 12
致谢 12
参考文献12
图1:突变体表型7
图2:其他突变体表型8
图3:ED在全基因组上的分布图8
图4:引物聚丙烯酰胺凝胶电泳图12
表1 :引物信息表 7
表2:PCR反应体系9
表3:INDEL关联区域统计11
表4:亲本DNA浓度11
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络研究
生物技术 韩美霞
引言
引言
KNOXI基因在单叶植物和复叶植物的表达中存在差异。叶原基形成后,KNOXI基因是否重新上调表达,成为区分单叶植物和复叶植物发育模式的关键。KNOXI对于不同植物的复叶发育的调控作用是不相同的。对于番茄和碎米荠等模式植物来说,该途径起到关键作用,该基因的表达水平会影响到复叶的小叶数目;对于十字花科植物来说,KNOXI调控叶形态发育的分子途径具有保守性;对于豆科植物来说,复叶发育的调控有其特殊性,它不仅仅受到KNOXI的调控,还有UNI途径的调控。
叶片的发育都是从顶端分生组织的侧面开始的,顶端分生组织具有维持自我生长和分化的能力。在早期的研究中发现,KNOXI蛋白是参与维持顶端分生组织分生能力。在不同的植物生长中,KNOXI基因的表达模式和作用不完全相同。在番茄和碎米荠等模式植物中的研究表明,KNOXI分子途径在复叶发育中起关键作用,决定复叶的小叶数目。
KNOX(KNOTTED1like homeobox genes)基因家族转录因子几乎存在于所有植物中,系统进化分析将其分为KNOXI、KNOXII和KNOXM三个分支。KNOXI基因是分生组织活性维持的重要因子,主要在未分化细胞中表达。当顶端分生组织周缘区细胞被招募形成初始叶原基时,KNOXI基因表达下调。对大多数单叶植物而言,这种下调是永久的。然而,对番茄等复叶植物而言,这种下调是暂时的,在复叶原基后续的发育中,KNOXI基因表达被重新激活[1]。因此,复叶原基维持一段时间的分生组织活性,小叶原基得以形成。在番茄中,沉默或突变KNOXI基因,复叶的小叶数目减少[2, 3];反之,若上调表达KNOXI基因,复叶的小叶数目增加,甚至出现“超级复叶”的现象[46]。
在十字花科植物中的研究表明,KNOXI调控叶形态发育的分子途径具有保守性[7, 8]。组成的复叶,若KNOXI基因ChSTM和ChKNAT1突变,则复叶小叶数目减少,甚至形成单叶[2]。而在单叶植物拟南芥中,KNOXI基因不在叶原基表达,但过量表达KNOXI基因也会导致叶片着生额外的小叶片[9]。
通过遗传学和分子生物学等方法,许多调控复叶发育的关键因子被鉴定出来,这些因子在转录水平调控KNOXI基因的表达或蛋白水平调控KNOXI的功能,构成KNOXI分子途径[1]。例如,在碎米荠中,ASYMMETRIC LEAVES复合体的各个组分抑制KNOXI基因表达[8, 10]。番茄中KNOXM因子PTS(PETROSELINUM)是KNOXI的功能促进因子,PTS和KNOXI的抑制子在蛋白水平相互作用,解除抑制子对KNOXI的抑制作用。在PTS基因功能获得性(gainoffunction)突变体中,PTS基因表达量上调,突变体复叶的小叶数目增加[11]。
豆科植物复叶发育有其特殊性,存在KNOXI和UNI两条分子途径,调控复叶发育,决定复叶的小叶数目。豆科植物是被子植物中三个最大的科之一,约有650属,含2万余种。系统发育研究结果显示[12],豆科植物中KNOXI基因的表达模式及其功能可分为两类情形:在进化分支IRLC(inverted repeat lacking clade)的豆科植物中(如豌豆和蒺藜苜蓿等,约600余种),KNOXI不在复叶中表达,不参与复叶发育调控。例如,在蒺藜苜蓿中,3个KNOXI基因的突变体,无论单突变体、双突变体,还是三突变体,其复叶发育正常[13]。而在nonIRLC豆科植物中(如绿豆、大豆、百脉根等,绝大多数豆科植物属于nonIRLC),KNOXI基因在复叶中表达,参与复叶发育[12]。例如,在百脉根中,过量表达KNOXI基因,复叶的小叶数目增加;反之,KNOXI基因表达量下调,则复叶小叶数目减少,甚至形成单叶[14]。

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