为了解鲤科鱼类的线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息，以期为种属鉴定提供参考依据，获取可查询到的14 种鲤科鱼类的线粒体基因组全序列进行分析。结果显示: 1) 14种鲤科线粒体基因组全序列长度在16,580 bp 到16,577 bp 之间，基因组的结构和基因种类与其它硬骨鱼类一致，均包含13个蛋白质编码区基因、22个tRNA、2个rRNA、1个非编码控制区（D-loop）和1个轻链复制起始区（OL区）。其中，斑马鱼、团头鲂和银鲫的基因的排列顺序与其他11种鱼类不同。2) 14种鲤科鱼类线粒体基因组全序列的GC含量为4.1％到5.2％，密码子第3位碱基处的GC含量为5.3％到6.1％，且明显高于密码子第1位和第2位。3) 基于14种鲤科鱼类线粒体基因组全序列构建的NJ树和ML树能够得出各物种亲缘关系远近，同源性程度高低。4) 14种鲤科鱼类线粒体基因组均呈现出较强的A+T偏向性和在密码子第3位碱基处呈现G偏好。5）GC含量和发育系统树的结合可以为鲤科鱼类的种属鉴定提供依据。
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言3
1材料与方法4
1．1线粒体基因组序列的获取和数据分类4
1．2数据分析4
1. 3系统进化分析5
1. 4 Circos分析 5
2 结果与分析5
2．1线粒体基因组的基本特征5
2. 2 NJ树状图和ML树状图的构建7
2. 3不同密码子位置的碱基分析8
2. 4线粒体基因组比较结果的可视化9
3讨论 10
3. 1不同区域GC含量不同10
3. 2线粒体基因组序列NJ树状图和ML树状图分析11
3.3不同密码子位置的碱基特征分析11
3.4线粒体基因组比较结果的分析11
致谢12
参考文献 12
基于线粒体基因组的鲤科鱼类进化分析及种属鉴定

原文链接：http://www.jxszl.com/nongxue/scyz/64909.html