使用BLAST等同源搜索方法在鲤鱼基因组中挖掘得到5个sPLA2-III家族基因，命名为Ccpla2g3a1、Ccpla2g3a2、Ccpla2g3b、Ccpla2g3c1和Ccpla2g3c2。Ccpla2g3as有7个显子，Ccpla2g3b和Ccpla2g3cs则均有4个外显子，他们的开放阅读框长度依次为1593 bp、1578 bp、1386 bp、2259 bp和2268 bp，分别编码530、525、461、752和755个氨基酸，均含有PLA2_bee_venom_like region，含有sPLA2-III家族的特征序列5对二硫键、3个活化位点和4个金属结合位点。鲤鱼和斑马鱼的垂直同源基因之间有着较高的相似性，Pla2g3as分别为84.6%和86%，Pla2g3b为74.3%，Pla2g3cs分别为85.2%和85%；但鲤鱼旁系同源基因之间的相似性则不高，为32.5~46.7%之间。染色体线性分析显示，雀鳝(2R鱼)有pla2g3a(b)、pla2g3c两个基因，在3R鱼pla2g3a(b)加倍出了pla2g3a、pla2g3b两个旁基因，但由于一条染色体上的pla2g3c丢失，只保留了一个pla2g3c基因，他们的上游基因比较保守，但下游基因发生了变异；鲤鱼sPLA2-III家族又各产生了两个旁基因（pla2g3b除外），其两侧已知基因均与斑马鱼一致。系统进化树显示硬骨鱼类和雀鳝的Pla2g3a以94%的置信值聚为一支，然后与除了斑马鱼和鲤鱼的其他硬骨鱼类的Pla2g3b(置信值96%)以88%置信值合并为一支，鲤鱼和斑马鱼Pla2g3b单独形成一支，所有Pla2g3c以100%置信度聚为一支。荧光定量PCR结果表明Ccpla2g3as在整个鲤鱼早期发育阶段表达量均较低，在成鱼肝脏中表达量最高（P<0.01）；Ccpla2g3b在鲤鱼受精后0.5h表达量最高，极显著高于25 h以后各取样点（P<0.01），但和12 h差异不显著，在成鱼性腺中表达量最高（P<0.01）；Ccpla2g3cs在0.5至60 h表达量均较低，120 h表达量则极显著增高（P<0.01），在成鱼脑中表达量最高（P<0.01），Ccpla2g3c2在肠中表达量也比较丰富。本文比较全面地揭示了鲤鱼sPLA2-III家族基因结构和表达特征，分析了他们之间的系统发育关系。 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: ￥351916072￥ 

目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words2
引言2
1材料与方法3
1.1材料 3
1.1.1实验鱼3
1.1.2实验试剂与仪器3
1.1.3实验引物3
1.2方法 3
1.2.1鲤鱼早期胚胎样品3
1.2.2鲤鱼组织表达样品3
1.2.3鲤鱼sPLA2III家族生物信息学分析4
1.2.4 RNA提取、逆转录及实时荧光定量PCR4
2结果与分析4
2.1鲤鱼sPLA2III家族基因挖掘4
2.1.1鲤鱼sPLA2III家族基因序列检索和染色体线性分析 4
2.1.2鲤鱼sPLA2III基因结构 5
2.1.3氨基酸序列比对 7
2.1.4遗传进化树分析 10
2.2鲤鱼sPLA2III家族基因表达 12
2.2.1鲤鱼早期胚胎不同发育阶段sPLA2III家族基因表达 12
2.2.2鲤鱼不同组织sPLA2III家族基因表达 12
3讨论 13
3.1鲤鱼sPLA2III家族基因序列 13
3.2鲤鱼sPLA2III家族基因表达特征 14
致谢15
参考文献15附录17
鲤鱼sPLA2III家族基因结构、系统发育和表达特征

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