基于ssr的不同群体鳜遗传多样性初步研究(附件)【字数：6956】
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法2
1.1实验材料 2
1.2方法 2
1.2.1微卫星引物合成2
1.2.2基因组DNA提取3
1.2.3 PCR扩增及产物电泳检测3
1.2.4数据处理和分析4
2结果与分析4
2.1微卫星引物筛选及PCR结果4
2.2遗传多样性分析5 2.3 HardyWeinberg平衡分析5 2.4群体遗传结构分析6 3讨论 6
3.1群体遗传多样性分析6
3.2群体HardyWeinberg平衡检测7
3.3群体间遗传分化7
3.4关于等位基因数7
致谢8
参考文献8
基于SSR的不同群体鳜遗传多样性初步研究
引言
鳜鱼（Siniperca chuatsi）俗称鳜花鱼、桂鱼、石桂鱼、季花鱼等，隶属硬骨鱼纲（Osteichthyes），鲈形目（Perciformes），鮨科（Serranidae），鳜亚科（Sinipercinae），主要分布在我国东部各大水系 *景先生毕设|www.jxszl.com +Q: &351916072&
，以及俄罗斯远东地区、日本、朝鲜半岛和越南等地[1]。鳜鱼是我国著有的名贵淡水鱼类，肉质细嫩，刺少肉多，味道鲜美，营养价值丰富，深受人们的喜爱[2]。
上世纪80年代中期开始，鳜鱼养殖规模不断扩大，产量迅速提高。近年来，因为过 度捕 捞以及水 域环境恶 化等原 因，鳜种质资源退化[3]。因此，对鳜展开遗传多样性研究，显得极 为重 要。目前，在分子水平研究鳜鱼遗传多样性的方法主要有RAPD标记技术和微卫星标记技术。杨受保等[4]采用RAPD技 术，对万 佛湖、长 江、秋 浦河3个不同鳜群 体开展了研究，发现其群 体内遗 传相 似系数分 别为0.8931、0.8839、0.9063，该结果说明鳜长 江群体的遗 传多样性比其 他2个地区的要高。方展强等[5]采用RAPD技 术，对来自鄱 阳湖的野 生鳜和南海省级鳜鱼良种场的养殖鳜进行了研究，发现两者的群 体内遗 传相似系 数分别为0.8547和0.9527，野 生鳜 群体的多 态位 百分 率为85.75 %，养 殖鳜群 体的为16.39 %，显而易见，鄱阳野生鳜的遗传多样性比南海养殖鳜的要高。
微卫星DNA又叫简单重复序列（Simple Sequence Repeats，SSRs），在真核生物的基因组中普遍分布，常表现出高 度的长 度多 态性[69]。因其操 作简单、多 态性高、重 复性好和共 显 性遗传等特点，而广泛应用于动、植物的遗 传图谱构 建、群 体遗 传多 样性分析、亲 缘关系分析和种 质资 源鉴定等方面[10]。彭敏燕[11]对采自赤壁、常德和怀化的3个不同野生翘嘴鳜群体进行SSR研究，得到的平 均基 因分 化指数（Fst）为0.0383，可见，3个群体间的遗 传分 化水 平较低。杨凯等[12]对湖北、广东的2个养殖翘嘴鳜群体以及采自长江的1个野生翘嘴鳜群体进行SSR研究分析比较，得到的平均期望杂合度（He）值分别为0.5472、0.4634和0.4811，可以看到，遗传多样性最高的为湖北养殖群体。但有关长江中下游水域的野生鳜群体和养殖群体的遗传多样性研究报道尚未见到。本课题对6个不同群体鳜的遗传多样性及群体间的遗传分化进行SSR分析，以期更好地保 护和恢 复鳜种 质资源。
1 材料与方法
1．1 实验材料
实验分析的鳜来自6个群体，分别采自长江铜陵江段（TL）、长江当涂江段（DT）、长江安庆江段（AQ）、太湖（TH）、高邮董氏养殖场（GY）、靖江滨江水产养殖场（JJ），每个群体的个体数依次为7尾、8尾、8尾、9尾、30尾、34尾，样品用无 水酒 精保存，并带回实验室备用。
1．2 方法
1．2．1 微卫星引物合成
微卫星引物序列参照匡刚桥[13]的研究，引物由上海生物工 程技 术服 务有限公司合成，从合成的41对引物中筛选出10对，引物信息见表1。
表1 经筛选的10对鳜鱼微卫星引物
Table 1 10 SSR primers available to PCR amplification in Siniperca chuatsi
位点
Locus
引物序列（5′3′）
primer sequences(5′3′)
退火温度（℃）Annealing temperature
产物长度（bp）
product size
G01
G03
G04
G06
G08
G09
G10
G12
G13
G14
AGCCATCACCATCTGCCTA
TGTGCGGTGTCTGTATTCG
原文链接：http://www.jxszl.com/nongxue/scyz/560781.html
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