稻瘟病菌moknr4结合蛋白的鉴定与功能分析【字数:6812】
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words4
引言4
1材料与方法4
1.1材料 4
1.2方法 5
1.2.1构建筛库诱饵载体5
1.2.2 酵母感受态制备5
1.2.3 酵母筛库5
1.2.4 阳性酵母质粒提取5
1.2.5 酵母质粒转化入大肠杆菌.......6
1.2.6 阳性质粒的获得6
1.2.7 酵母双杂交进行一对一互作验证6
1.2.8 构建互作蛋白编码基因敲除载体6
1.2.9 稻瘟转化7
1.2.10敲除突变体的功能分析7
2结果与分析7
2.1酵母双杂交实验初步筛选7
2.2阳性克隆测序 *景先生毕设|www.jxszl.com +Q: ¥351916072¥
比对分析9
2.3阳性克隆与诱饵质粒一对一互作验证9
2.4敲除载体构建与基因敲除10
2.5敲除突变体的功能分析11
3讨论11
4 致谢12
参考文献12
稻瘟病菌MoKnr4结合蛋白的鉴定与功能分析
引言
稻瘟病是一种世界性稻作病害,全球每年因稻瘟病造成的水稻产量损失达 11%~30%[5]。稻瘟病菌可在很多种植物上寄生,除水稻外,还包罗小麦、大麦等非常重要的经济作物。其中稻瘟病菌侵染水稻每年给水稻产量带来庞大的损失,进一步破解稻瘟菌侵染过程,对科研工作者来说是挑战也是机会。随着蛋白质组学的发展,对侵染途径中的关键蛋白的深入了解成为了进一步工作的突破口,而在蛋白质互作网络中连接信号通路的蛋白质成为枢纽蛋白,这种蛋白无疑是我们研究工作重要的突破口。
稻瘟病菌是一种丝状真菌,自然条件下主要以无性态分生孢子(两隔三细胞)进行传播和侵染。随着气流或雨水的传播,无性态分生孢子落在植物表面,感受到植物表面信号以后,开始萌发产生芽管,芽管进一步萌发在其顶端形成附着胞,附着胞产生巨大的膨压产生侵入钉寄主表面,并且进一步在寄主细胞内扩展。病斑表面产生分生孢子,从而完成一轮侵染循环[6][7]。
在酿酒酵母中,Knr4在甲壳素沉积以及细胞壁组装中有着重要的调节作用,是连接影响细胞壁合成,形态发生和细胞周期进程的信号传导途径的特征性IDP枢纽。CWI途径和钙调磷酸酶途径是控制细胞壁合成和完整性的两种主要途径,Knr4蛋白与这两条途径中的关键蛋白都互作,分别为CWI的Slt2 MAP激酶和钙应答途径的钙调磷酸酶。因此,Knr4成为了这两条信号传导途径中的一个连接节点。Knr4在酵母中的作用研究比较清楚,但是在丝状真菌中的生理生化作用报道甚少。实验室前期利用免疫共沉淀的方法,鉴定到致病因子MoMps1与MoKnr4相互作用,通过基因敲除MoKNR4,获得突变体菌株,发现MoKnr4参与调控了稻瘟病菌的生长、产孢、致病性等一系列生理过程,但MoKnr4究竟是如何调控这一系列的生物学过程,仍需进一步的实验加以证明。
材料与方法
1.1 材料
1.1.1 研究所采用的菌株及培养条件
稻瘟病菌:野生型菌株Guy11 培养环境:28℃ 避光培养
酵母菌株:AH109 培养环境:30℃ 避光培养
大肠杆菌:DH5α/JM109 培养环境:37℃ 培养
1.1.2 研究所使用的培养基
CM培养基(10 g 葡萄糖;2 g 蛋白胨;1 g 酵母提取物;1 g 酪蛋白氨基酸;25 ml 40×氮盐;1 ml 金属离子;1 ml 维他命;3 g 琼脂粉;定容至1 L);TB3培养基(3 g 酵母提取物;3 g 酪蛋白提取物;200 g蔗糖;定容至1 L);LB培养基(10 g 胰蛋白胨;5 g 酵母提取物;10 g Nacl ;定容至1L);YPD培养基(10 g 酵母提取物;20 g 蛋白胨;20 g 葡萄糖;定容至1L);二缺、三缺、四缺培养基(0.64 g SD/Leu/Trp;SD/His/Leu/Trp;SD/Ade/His/Leu/Trp粉末;5 g 硫酸铵;20 g 葡萄糖;1.7 g Yeast Nitrogen Base without Amino Acids without Ammonnium Sulfare;4 g Agar A;定容至1L)
1.1.3 主要试剂
酵母转化试剂盒;酵母质粒提取试剂盒;PTC、STC;2% CTAB;氯仿;无水乙醇;氨苄;卡那霉素等。
1.2 方法
1.2.1 构建筛库诱饵载体
在稻瘟病菌数据库中找到MoKNR4的基因序列,以稻瘟菌cDNA为模板进行PCR扩增,之后电泳验证目的片段,大小正确进行跑胶回收,酶切骨架pGBKT7以及目标片段,过夜连接后转化入大肠杆菌感受态细胞。验证正确后摇菌送测序,测序正确用于后续转化实验[8]。
1.2.2 酵母感受态的制备
(1)在制备酵母感受态细胞前一天晚上摇菌,挑取AH109菌板上的单菌落至指定培养基中,摇培16 h。
(2)400 g,4 ℃,5 min,冷冻离心,弃上清。
(3)为洗去表面培养基,将细胞在10 ml TE缓冲液中洗涤,混匀后,400 g,冷冻离心5 min,倒掉上清。
(4)将沉淀于5 ml醋酸锂溶液中摇匀,注意动作要轻缓。66 rpm的摇床上培养半小时。
(5)400 g, 4 ℃,5 min,冷冻离心,弃上清。
原文链接:http://www.jxszl.com/nongxue/zwbh/561614.html
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