藏梨遗传多样性和群体结构的ssr标记分析【字数:6552】
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法2
1.1植物材料 2
1.2 DNA提取与质量检测3
1.3 PCR扩增与聚丙烯酰胺凝胶电泳3
1.4 藏梨的遗传多样性与聚类分析5
2 结果与分析5
2.1 藏梨遗传多样性分析6
2.2 藏梨的亲缘关系分析 7
2.3 藏梨的遗传分化8
2.4 藏梨的地理种群关系10
3讨论11
致谢 12
参考文献 12
藏梨遗传多样性和群体结构的SSR标记分析
引言
引言:梨属植物(Pyrus L.)属于蔷薇科(Rosaceae)、苹果亚科(Maloideae)或者梨亚科(Pomoideae)[1]。化石证据表明,梨的野生种起源于中国西部或西南部的山区[2]。据古籍记载,梨在中国的栽培历史已有3000多年[3]。目前,除了海南省,梨的栽培区域已遍布全国各地。且产量仅次于苹果和葡萄,居第三。得益于广袤的领土、多变的地形和复杂的气候条件,我国的梨种质资源异常丰富。由于梨自交不亲和的特性,梨属种间不存在生殖隔离,种内和种间杂交的普遍性更丰富了梨的种质资源多样性[2],同时梨复杂的遗传背景,也增加了种质资源鉴定和分类关系研究的难度。
19世纪20年代,分类学家们通过地理分布和形态特征来鉴别划分梨的种和品种[4]。随后生物评价方法迅猛发展,譬如酚类成分、同工酶分析和蛋白组成等,都已广泛应用于系统发育分 *景先生毕设|www.jxszl.com +Q: ^351916072^
析研究中[5]。但上述方法都容易受环境因素的影响。近年来,随着砀山酥梨全基因组数据的公布[6],大量覆盖全基因组的分子标记被开发出来,并已应用于梨种间和种内的遗传多样性分析中[7]。而SSR(Simple sequence repeat,简单序列重复)标记以其多态性高、共显性、重复性好和可转移性等突出优点[8],在评价遗传多样性[9]、构建遗传连锁图谱[10]、揭示进化历史[11]和分子辅助育种[12]等方面得到广泛应用。
近年来迅速发展的分子标记技术已经广泛应用于梨属植物的系统关系和品种亲缘关系的研究中。Teng等[13]用22个RAPD标记分析72个新疆地方种,发现了新疆梨是杂种起源。Liu等[14]用14个核SSR标记和2个叶绿体间区评价浙江杜梨的遗传多样性,发现77个杜梨存在明显的地理结构所致的遗传分化。Zheng等[11]研究了来自25个种的110个品种的亲缘关系,提出网状进化和辐射进化是梨属植物的两个主要进化方式。中国西南部地区因其极丰富的野生动植物资源而成为全球遗传多样性的研究热点[15],有学者探究了分布在云南省川梨资源的遗传多样性和亲缘关系[1617]。本研究发现,位于我国西藏东部、四川西部和云南西北部交界处的山区,生长着许多野生或半野生的梨种质资源,这些位于西南藏区的梨大多存活超过100年,品质较差,但是抗性极高,作为潜在的育种资源对于提高梨的抗逆性具有十分重要的意义。为进一步保护和利用这些资源并为育种工作提供基础,更多中国西南部梨属植物的研究有待开展。
本研究以分布在我国四川、云南和贵州交界处的藏梨为研究对象,主要研究内容包括:(1)基于核基因SSR标记的藏梨遗传多样性评价;(2)藏梨与砂梨、秋子梨的亲缘关系;(3)分析藏梨的起源和传播。
1 材料与方法
1.1 植物材料
本研究共选用67份试验材料,其中藏梨29份,分布在西南地区的砂梨30份,作为参照的秋子梨8份。29份藏梨品种采自西南藏区,30份砂梨和8份秋子梨采自大学江浦梨资源圃和武汉国家梨资源圃。
表1 67份梨品种资源
Table 1 The 67 genotypes of Pyrus used in this study
编号No.
品种名Sample
来源地Origin
编号No.
品种名Sample
来源地Origin
1
贡川梨
四川泸定
35
汉源酸梨
四川汉源
2
罐罐梨
四川泸定
36
梨园罐罐梨
四川汉源
3
藏梨3
四川泸定
37
梨园麻子梨
四川汉源
4
藏梨4
四川泸定
38
梨园红皮梨
四川汉源
5
黄皮梨
四川泸定
39
梨园杨称梨
四川汉源
6
蜂蜜梨
四川泸定
40
梨园蜂蜜梨
四川汉源
7
乡城藏梨
四川乡城
原文链接:http://www.jxszl.com/nongxue/yy/561467.html