摘 要实验以鸡蛋中的卵清蛋白、卵转铁蛋白、卵黄蛋白原-1前体、卵黄蛋白原-2前体为原料蛋白质。对蛋白质进行虚拟酶解，对酶解结果中的三肽进行生物活性和水溶性预测，筛选出生物活性大于0.5，水溶性好的三肽22个。借助ADMETlab程序进行ADMET性质预测，选出19个适宜三肽序列。使用AutoDock软件对CaSR与三肽进行对接操作，根据对接构象和已知配体的结合能，筛选出12个结合构象较稳定的三肽。对接结果显示，复合物主要通过氢键，范德华力，离子作用力和碳氢键连接。其中三肽FDR、FQK、IGR、WGK、FKP、AGK、ASE、FTR与CaSR的结合稳定，而三肽ADW、GDF、LGR、IDA与CaSR的结合构象中存在着影响稳定性的因素。分析三肽与CaSR的结合构象，得到可能的高活性氨基酸结合位点，其中氢键作用位点D401（与11个三肽结合）、E405（与7个三肽结合）、D500（与5个三肽结合）；范德华力位点S303（与9个三肽结合）、Y411（与8个三肽结合）、T412（与8个三肽结合）、P407（与6个三肽结合）、S502（与5个三肽结合）、V504（与4个三肽结合）。
目录
摘要4
关键词4
Abstract5
Key words5
引言1
1 材料与方法2
1.1 材料与设备2
1．1．1 鸡蛋源蛋白质原料2
1．1．2 钙敏感受体（CaSR）蛋白2
1．1．3 实验设备2
1．2 实验方案2
1．2．1 虚拟酶解2
1．2．2 生物活性及溶解性预测2
1．2．3 ADMET 性质预测2
1．2．4 分子对接3
1．2．4．1 准备三肽配体分子3
1．2．4．2 准备CaSR蛋白受体分子3
1．2．4．3 分子对接3
1．2．5 结果分析3
1．2．5．1 阳性对照及结合能评价3
1．2．5．1 结合位点分析3
2 结果与分析 3
2．1 虚拟水解及三肽筛选3
2．1．1 卵清蛋白 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ^351916072# 
虚拟水解及三肽筛选3
2．1．2 卵转铁蛋白虚拟水解及三肽筛选4
2．1．3 卵黄蛋白原1前体虚拟水解及三肽筛选4
2．1．4 卵黄蛋白原2前体虚拟水解及三肽筛选5
3 ADMET性质预测6
2．3 分子对接结果分析8
2．3．1 CaSR受体的处理8
2．3．2 阳性对照及结合能评价8
2．3．2．1 卵转铁蛋白源三肽8
2．3．2．2 卵黄蛋白原1前体源三肽8
2．3．2．3 卵黄蛋白原2前体源三肽9
2．3．3 结合位点分析9
3．讨论 16
3．1 鸡蛋的应用前景16
3．2 CaSR及其激活剂研究现状16
3．3 分子对接的应用前景及优缺点16
致谢17
参考文献17
基于分子对接的鸡蛋源CaSR激活肽高通量筛选
引言
近年来，CaSR及其激动剂的结构和作用的研究逐渐成为医学，生命科学等领域的研究重点。钙敏感受体（简称CaSR）是一个由1078个氨基酸残基组成的蛋白质，CaSR分子由７个片段构成，属于Ｇ蛋白偶联受体Ｃ家族的第二组[1]。CaSR主要存在于细胞膜上，在人体内发布十分广泛，在肾脏、骨、甲状腺旁腺细胞、甲状腺C细胞中均有分布[2]。CaSR对人体内钙稳态维持非常重要，它可以通过感知细胞外的钙离子浓度的细微改变，然后调节甲状旁腺分泌降钙素的量和肾脏生成的尿液中钙的含量，来协助调节人体血液中的钙离子水平的稳定[3]。CaSR还参与了人体内许多重要的生理生化过程，如参与基因表达、增殖分化、细胞凋亡、细胞分泌、离子通道活化等过程[4]。
钙敏感受体激活剂主要分为两类，一类是非选择性的激活剂，包括多价阳离子无机物和多价阴离子有机物，另一类为选择性的激活剂，选择性发挥作用，主要需要钙离子或其它一类激动剂存在[5]。CaSR激动剂主要作用是模仿或增强细胞外的Ca2+对CaSR的作用[2]。研究发现，多种L氨基酸也是钙敏感激动剂[6]。钙敏感受体激活剂被应用于多种疾病的治疗，现在研究发现，钙敏感受体激动剂可以调节甲状旁腺素的分泌；与心血管疾病有关，参与调控心肌兴奋收缩偶联；与许多消化道疾病有关，如影响胃酸分泌和胃溃疡；还可以促进骨组织的代谢，可用于骨质疏松的治疗等[7]。近年来，越来越多的研究者开始关注钙敏感受体激动剂的结构与作用机制，高活性CaSR激活肽的发掘也是其中的一个研究热点。
随着科学技术的不断发展，越来越多的活性肽研究中开始使用计算机辅助技术[8]。分子对接方法主要有三种[9]，其一是刚性对接[10]，即对接双方构象不发生改变，仅空间位置等改变，该方法具有简单快捷的优点，多用于处理大结构的分子，如核酸和蛋白质的对接。第二种是半柔性对接[11]，顾名思义，对接过程中配体分子构相可改变而受体构象固定，这种方法使用率最高，适合大分子与小分子的分子对接。第三种方法是柔性对接，受体和配体构象都不是固定的，该方法计算量较大，效率较低，但对接精度较高。实验使用CaSR与三肽分子进行半柔性对接，对CaSR激活肽进行筛选，不仅可以减少工作强度、缩小后期人工筛选的范围、降低实验成本和使研发周期缩短，还能提高后续实验的成功机率[12]。
实验选择鸡蛋源蛋白质作为原料。鸡蛋是一种极为常见的食品原料，含有新生命诞生及生长过程中所必需的各种物质，从营养学角度来看，鸡蛋蛋白质具有很好的氨基酸比例，非常适合人们食用[13]。鸡蛋不仅在食品行业应用广泛，在生命科学，医药领域也有应用，鸡蛋中丰富的蛋白质也一直是生物活性肽发掘的宝库[12]。禽类的蛋清是高粘性的液体[14]，蛋白质含量约占11%，其中卵清蛋白占鸡蛋蛋白质的54%，卵转铁蛋白占13%，溶菌酶和卵类粘蛋白各占3.5%[15]。蛋黄中的蛋白质含量约为17%，分为蛋白和脂蛋白，蛋白分布在蛋黄的浆液中，是水溶性蛋白，主要有三种卵黄蛋白；而脂蛋白存在与蛋黄中的颗粒状部位，主要是卵黄磷蛋白[13]。我国的鸡蛋产值在不断提高，但是蛋类的加工产值在总产值中的占比仍然偏低[16]，这意味着鸡蛋的价值并没有得到完全的体现，对其附加价值挖掘还不够。因此，积极探索对鸡蛋中的丰富的生物活性成分的利用方法是提高蛋类利用率和附加价值的迫切所需[17]。

原文链接：http://www.jxszl.com/swgc/spzlyaq/606633.html