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土荆芥ssr与msap数据分析【字数:8485】

2024-11-03 09:38编辑: www.jxszl.com景先生毕设
土荆芥(Chenopodium ambrosioides L.)是原产于南美洲的入侵物种,于1919年侵入我国。作为一种入侵物种,土荆芥繁殖能力极强,同时对于多种重金属(Mn,Pb等)具有较强的积累能力。土荆芥这种对外界重金属环境的抵抗能力来自于其适应性进化的能力。本研究通过对实验室前期产生的SSR与MSAP数据进行遗传多样性分析与表观遗传学分析发现122个土荆芥种群发生较高的遗传分化,其主要来源于地理位置的差异;2土荆芥种群内的纯合子过量而杂合子缺失,这表明土荆芥种群内部普遍存在近亲繁殖的现象;3野外土荆芥的表观遗传分化与遗传分化相类似,也是分为二组,一组为宜兴(YX)、芜湖(WH)、铜陵 (TL)、宿松(SS)和栖霞(QX)种群,其他来源为另外一组4土荆芥有表观遗传分化的趋势,表明其表观遗传分化也在受到重金属的影响。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法 1
1.1基于SSR数据的遗传变异学分析 2
1.1.1实验材料 2
1.1.2土荆芥DNA的提取 3
1.1.3PCR与荧光毛细管电泳获取SSR数据4
1.1.4各SSR位点的遗传多样性分析 4
1.1.5土荆芥种群的遗传多样性分析 4
1.1.6土荆芥种群的遗传结构分析 4
1.1.7土荆芥种群的动态分析 4
1.2基于MSAP数据的野外土荆芥表观遗传学析 5
1.2.1实验材料 5
1.2.2MSAP数据获取部分 5
1.2.3数据获取及分析 5
2结果与分析 5
2.1基于SSR数据的土荆芥遗传多样性分析 5
2.1.1 12对SSR引物的遗传多样性分析5
2.1.2土荆芥种群遗传多样性分析 6
2.1.3土荆芥种群遗传结构11
2.1.4土荆芥种群聚类分析12
2.1.5土荆芥种群动态分析13
2.2野外土荆芥MSAP数据分析 14
2.2.1土荆芥种群甲基化水平的差 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ^351916072
异14
2.2.2土荆芥甲基化水平与生境的关系16
2.2.3土荆芥甲基化水平的主成分分析16
2.2.4土荆芥种群AMOVA分析18
3讨论19
3.1土荆芥SSR遗传多样性分析19
3.2土荆芥MSAP分析 20
3.3综合20
致谢20
参考文献20
附录1 土荆芥种群当代迁移率22
附录2 土荆芥种群历史迁移率36
附录3 土荆芥MSAP分组AMOVA结果48
土荆芥SSR及MSAP数据分析

原文链接:http://www.jxszl.com/swgc/smkx/606519.html