目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法2
1.1实验材料 2
1.1.1营养土与营养液2
1.1.2仪器设备2
1.2实验方法2
1.2.1植物种植2
1.2.2 RNA提取2
1.2.3数据分析3
2结果与分析4
2.1拟南芥mrg1 mrg2突变体差异表达基因分析4
2.2 mrg1 mrg2 DAG12差异表达基因与常见组蛋白修饰下游基因的相关性分析5
2.3 mrg1 mrg2 DAG12与hda6差异表达基因关系分析9
2.4 mrg1 mrg2 DAG12与hda19差异表达基因关系分析10
3 讨论 12
致谢13
参考文献13
转录组数据分析MRG1和MRG2的多重功能
摘 要
组蛋白H3K36三甲基化与各种转录事件有关，通过招募特定的读码蛋白到其下游基因进行转录调控。在拟南芥中，MRG1和MRG2是组蛋白H3K36三甲基化的读码蛋白，在调控开花和下胚轴伸长等生物过程中具有重要作用。前期研究发现，MRG1/2除了可以与组蛋白乙酰化复合体NuA4结合，也可以结合组蛋白去乙酰酶HDA6和HDA19，但是否共同参与生物学过程仍不清楚。本课题利用基因芯片技术，获得了拟南芥mrg1 mrg2双突变体和野生型幼苗期地上部分组织的全基因转录组数据；通过NCBI数据库获得了hda6和hda19的差异表达基因。利用生物信息学方法分析了MRG1/2下游基因与各类组蛋白修饰的关系，以及可能与HDA6或HDA19共同参与调控的生物学过程。结果表明，MRG1/2主要调控H3K27me3修饰的基因，这类基因主要与响应刺激、植物防御反应、细胞程序性死亡和发育过程等高度相关。同时，MRG1/2可与HDA6或HDA19参与不同的生物过程。

原文链接：http://www.jxszl.com/swgc/smkx/606495.html