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蚕豆春化基因的生物信息学分析及克隆【字数:11395】

2024-11-03 09:28编辑: www.jxszl.com景先生毕设

目录
摘要 I
ABSTRACT II
第一章 选题背景和文献综述 1
1.1 选题背景 1
1.2 文献综述 1
1.2.1 春化作用研究进展 1
1.2.1.1 拟南芥春化作用 2
1.2.1.2 小麦春化作用 3
1.2.1.3 蚕豆春化作用 3
1.2.2 春化相关基因研究进展 3
1.2.2.1 SOC1基因 3
1.2.2.2 ADO3基因 4
1.2.2.3 GI基因 4
第二章 实验方案论证与过程论述 6
2.1 实验方案论证 6
2.1.1 基因克隆方法和生物信息学方法简述 6
2.1.2 实验方案及特点 6
2.2 实验过程论述 6
2.2.1 植物材料 6
2.2.2 菌株及质粒 6
2.2.3 试剂 7
2.2.4 试验仪器 7
2.2.5 试验方法 7
2.2.5.1 VfADO3、VfSOC1和VfGI的克隆及载体的构建 7
2.2.5.2 普通taq酶扩增及反应 7
2.2.5.3 高保真酶扩增 8
2.2.5.4 凝胶回收 8
2.2.5.5 目的基因连接克隆载体 9
2.2.5.6 菌落PCR 10
2.2.5.7 VfADO3、Vf SOC1和VfGI生物信息学分析 10
第三章 结果分析 12
3.1 蚕豆VfADO3、VfSOC1和VfGI的克隆与载体的构建 12
3.1.1 VfADO3、VfSOC1和VfGI的克隆 12
3.1.2 载体的构建结果 12
3.2 蚕豆VfADO3、VfSOC1和VfGI的生物信息学分析 13
3.2.1 蚕豆春化相关基因编码蛋白理化性质分析 13
3.2.1.1 VfADO3编码蛋白理化性质分析 13
3.2.1.2 VfSOC1编码蛋白理化性质分析 14 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: @351916072

3.2.1.3 VfGI编码蛋白理化性质分析 15
3.2.2 蚕豆春化相关基因编码蛋白结构分析 17
3.2.2.1 VfADO3蛋白结构预测 17
3.2.2.2 VfSOC1蛋白结构预测 19
3.2.2.3 VfGI蛋白结构预测 20
3.2.3 蚕豆春化相关基因同源蛋白序列对比及进化树构建 21
3.2.3.1 VfADO3同源蛋白序列对比及进化树构建 21
3.2.3.2 VfSOC1同源蛋白序列对比及进化树构建 23
3.2.3.3 VfGI同源蛋白序列对比及进化树构建 25
第四章 讨论与结论 27
4.1 讨论 27
4.2 结论 27
参考文献 29
致谢 31
附录 32
蚕豆春化基因的生物信息学分析及克隆
摘要
蚕豆(Vicia faba L.)是冬季豆科作物,生育期较长。研究表明通过人工春化能够大大缩短蚕豆的生育期,促使其提前开花,这在蚕豆生产中具有重要意义。然而目前关于蚕豆春化机制及其相关基因尚不明确。前期研究中,我们对春化前后的蚕豆样本进行了转录组测序,分析差异表达基因获得三个春化相关基因——VfADO3、VfSOC1和VfGI。本研究利用生物信息学相关软件分析了三个蚕豆春化基因,并进行了分子克隆。结果表明,VfADO3、VfSOC1和VfGI蛋白分别由637、217和1176个氨基酸残基构成,均无跨膜区和信号肽。VfADO3有三个结构域,VfSOC1有两个结构域,VfGI无结构域。序列比对及进化分析显示,蚕豆三个春化蛋白均与苜蓿中相应蛋白序列相似性最高。亚细胞定位预测显示,VfADO3可能主要定位于细胞质和细胞核中,VfSOC1和VfGI可能主要定位于细胞核。同时,我们成功从蚕豆的cDNA中克隆到三个基因,并构建了克隆载体。本研究初步对蚕豆春化基因VfADO3、VfSOC1和VfGI及其编码蛋白进行了生物信息学分析,且成功克隆了这三个基因,为蚕豆春化机制的后续研究奠定了一定的基础。

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