目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言4
1材料与方法6
1.1数据来源和处理 6
1.1.1原始数据的下载 6
1.1.2原始数据的预处理6
1.2基因注释6
1.3 GO分析6
2结果与分析6
2.1 RNAseq突变的数目和分布7
2.2 RNAseq突变的碱基偏好性8
2.3 RNAseq突变相关的基因及其功能10
3 讨论11
致谢12
附表12
参考文献16
普通小麦RNAseq测序错误的分析与评估
摘 要
小麦基因组庞大，重复序列比例高，且性状受多基因控制，易受环境影响。因此普通小麦的基因组拼装、重测序等研究较为困难。RNAseq是目前常用的一种用于研究材料序列变异和转录丰度的手段。小麦RNAseq相对于DNAseq有显著优势，既避免了大量的重复序列，也节省了成本，因此在小麦中被广泛使用。目前有多个研究利用RNAseq寻找材料间的差异，从而设计标记并对性状进行定位。但由于RNAseq的技术特点，其在测序过程中存在不可避免的误差。本课题以已有参考基因组的六倍体小麦中国春为材料，分析其已公开发表的大量转录组测序数据，以中国春转录组测序数据中所发现的突变位点为研究对象，研究其碱基偏好性，基因结构以及基因功能的特点，从而找出其中转录组与基因组序列的差异以及出现变异的规律。

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