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小麦ein3eil转录因子家族的鉴定及生物信息学分析【字数:9002】

2024-11-03 13:32编辑: www.jxszl.com景先生毕设

目录
摘 要 1
关键词 1
ABSTRACT 2
KEYWORDS 2
引言 3
1 材料与方法 5
1.1 小麦EIN3/EIL基因家族成员的鉴定 5
1.2 小麦EIN3/EIL各成员的系统进化分析 5
1.3 小麦EIN3/EIL各成员蛋白的一级结构和理化性质分析 5
1.4 小麦EIN3/EIL各成员的启动子顺式作用元件预测 5
1.5 小麦EIN3/EIL各成员的内含子外显子结构分析 6
1.6 小麦EIN3/EIL各成员的保守结构域、Motifs分布以及在染色体上的分布情况 6
1.6.1 小麦EIN3/EIL各基因成员的保守结构域分析 6
1.6.2 小麦EIN3/EIL各基因成员蛋白的Motifs分布分析 6
1.6.3 小麦EIN3/EIL各基因成员的染色体分布分析 6
1.7 基于转录组数据,小麦EIN3/EIL在各种胁迫下的表达谱分析 6
2 结果与分析 7
2.1 小麦EIN3/EIL基因家族成员的鉴定 7
2.2 小麦EIN3/EIL各成员的系统进化分析 8
2.3 小麦EIN3/EIL各成员蛋白的一级结构和理化性质分析 9
2.4 小麦EIN3/EIL各成员的启动子顺式作用元件预测 10
2.5 小麦EIN3/EIL各成员的内含子外显子结构分析 11
2.6 小麦EIN3/EIL各成员的保守结构域、Motifs分布以及在染色体上的分布情况 12
2.6.1 小麦EIN3/EIL各基因成员的保守结构域分析 12
2.6.2 小麦EIN3/EIL各基因成员蛋白的Motifs分布分析 13
2.6.3 小麦EIN3/EIL各基因成员的染色体分布分析 14
2.7 基于转录组数据,小麦EIN3/EIL在各种胁迫下的表达谱分析 15
3讨论 19
致谢 21
参考文献 22
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家族的鉴定及生物信息学分析
摘 要
乙烯(Ethylene, ET)是一种气态的植物激素,它调控着植物各种生长发育过程,包括种子萌发、根的形成和分化、开花、衰老、果实成熟,同时,乙烯还参与组织损伤、低温危害等胁迫或者病原体侵害的防御反应等等。EIN3/EIL家族成员是乙烯信号转导途径中的关键基因。本研究利用生物信息学手段从普通小麦(Triticum aestivum L.)基因组中鉴定出所有的EIN3/EIL基因成员,并对它们进行系统性的分析,从基因内含子外显子结构、启动子顺式作用调控元件预测、保守基序分析、染色体分布及不同组织中的表达水平等方面开展研究,初步探讨EIN3/EIL基因家族与抗病和抗逆的联系。获得的主要结论如下:
1、小麦中总共鉴定出16个EIN3/EIL基因家族成员。
2、TaEIL家族进化程多样,其家族蛋白又分为3个亚家族。内含子-外显子结构分析显示,其中有6个基因没有内含子。
3、TaEIN3/EIL基因不仅受茉莉酸甲酯(MeJA)、生长素(IAA)、赤霉素(GA)和脱落酸(ABA)诱导,同时受光、低温、干旱等非生物胁迫诱导。
4、 TaEIN3/EIL在小麦叶和芽中均有表达,其中TraesCS4B02G175100.1和TraesCS4D02G 177000.1基因的表达量显著高于其它基因。转录组分析显示,这两个基因同时受多种生物和非生物胁迫的诱导,表达水平显著高于其它基因的表达量,说明其在小麦非生物和生物胁迫反应中有重要的调控作用。

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