目录
摘要 I
Abstract II
1 全基因组关联分析 2
1.1 全基因组关联分析的技术路线 2
1.1.1 种质材料的选择 2
1.1.2 对目标性状的表型进行鉴定 3
1.1.3 基因型测定 3
1.1.4 群体结构分析 3
1.1.5 关联作图 3
1.2 全基因组关联分析的优势与劣势 3
1.3 全基因组关联分析在水稻中的应用 4
2 材料与方法 5
1.1 实验材料 5
1.2 表型鉴定 5
1.3 数据处理和关联分析 5
1.3.1 表型数据统计分析 5
3 结果和分析 6
3.1 表型数据分析 6
3.2 全基因组关联分析结果 7
4 讨论 21
4.1 全基因组关联分析的不足 21
4.2 研究结果分析 21
致谢 21
参考文献 23
全基因组关联分析（GWAS）挖掘水稻子房长度和柱头长度优异等位基因
摘要
作为全世界最重要的粮食作物之一，以水稻（Oryza Sativa L.）作为主食来源是的人口达到了世界总人口的二分之一。由于我国土地资源有限，就需要加强杂交水稻高产育种，促进杂交水稻高产育种研究进程，提高水稻单位面积产量，从而保证人们不断增长的粮食需求。水稻花器构造有利于自交而不利于异交,导致制种产量低,这种特性成为杂交稻制种的限制因素之一。因此，改良水稻的花器性状，对于提高异交结实率、增加杂交水稻制种产量具有重要实践意义。此前对于水稻子房长度和柱头长度的相关研究较少，仍有大量优异基因等待发掘。本研究通过调查944个不同地区水稻品种的子房长度和柱头长度，并对其进行全基因组关联分析 (genomewide association study, GWAS) ，得到影响子房长度的 SNP 位点 60 个，影响柱头长度的SNP位点238个。此结果为以后研究控制子房长度和柱头长度新基因的发掘提供了重要支撑。

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