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疣跳科的线粒体基因组结构特征研究【字数:6327】

2024-11-03 13:25编辑: www.jxszl.com景先生毕设

目录
摘 要 1
关键词 1
ABSTRACT 2
KEY WORDS 2
引言 2
1 材料与方法 4
1.1 实验材料 4
1.2 实验仪器与试剂 4
1.2.1 实验仪器 4
1.2.2 实验试剂 4
1.3 实验步骤 5
1.3.1 DNA提取 5
1.3.2 PCR扩增 6
1.3.3 电泳检测与Sanger测序 6
1.3.4 高通量测序 7
2 数据的处理与分析 8
2.1 系统、软件及数据库 8
2.2 数据处理 8
2.2.1 线粒体基因组组装 8
2.2.2 组装结果的注释 9
2.2.3 系统发育树构建 10
3 结果与分析 11
3.1 线粒体基因组结构分析 11
3.2 基于线粒体基因组的系统发育分析 17
4 讨论 18
5 总结与展望 19
致谢 20
参考文献: 21
疣跳科的线粒体基因组结构特征研究
摘 要
跳虫简称䖴,又称粘管虫,是弹尾纲动物的俗称。它们的生活环境复杂,但大多数生活在土壤及其相关环境中,是三大土壤动物之一(线虫、跳虫、螨)。疣跳科是少数不会跳跃的跳虫之一,虫体密布微小颗粒,体背有疣状突起,在我国分布广泛,但目前相关研究较少。本课题利用高通量测序以及生物信息学技术,对疣跳科4个物种(Bilobella aurantiaca、Neanura muscorum、Pseudachorutes palmiensis、Friesea griseas)的线粒体基因组进行组装、注释,并对4个样本的线粒体基因组全序列长度、碱基含量进行了分析。结果显示:(1)4种疣跳的线粒体基因组全序列长度介于1544217110 bp之间,平均为16408 bp;(2)4种疣跳均包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因和2个rRNA基因;(3)样品物种的碱基组成 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: &351916072
较为相似,A+T含量较高,平均含量为69.34%;(4)4种疣跳各分支支持率较高(>99.5%)且亲缘关系较近,与传统分类结果一致。本课题填补了疣跳科相关研究的空白,补充弹尾纲线粒体基因组数据,为后续的物种多样性检测和系统发育研究提供了数据基础。

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