目录
摘要3
关键词3
Abstract4
Key words4
1 研究背景5
1.1 DNA测序技术5
1.2 基因组组装技术介绍5
1.3 昆虫基因组学及跳虫基因组学研究概况6
2 材料与方法7
2.1 材料 7
2.1.1 白符䖴基因组测序数据7
2.2 组装方法7
2.2.1 系统7
2.2.2软件8
2.2.3 数据库8
2.2.4 数据质量控制及基因组评估8
2.2.5 基因组和转录组组装及其质量评估9
3 结果与分析9
3.1 基因组评估与分析9
3.2 基因组组装结果评估10
4 讨论13
5 展望 13
致谢13
参考文献14
土壤模式动物白符䖴（Folsomia candida）基因组的重新组装
摘 要
昆虫是地球上种类最多样化的动物种群，跳虫作为典型的土壤动物在土壤生态系统中扮演了重要角色，并与人类生活有着十分密切的关系。白符䖴（Folsomia candida）因其具有生长周期短、繁殖快、操作简便等多种优点被广泛用于生态毒理实验中。为了提升基因组组装连续性和完整性，本研究对已公开的PacBio测序数据进行了重新组装，并对组装结果进行评估，新组装的基因组大小为221.09 Mb，共113条序列（scaffolds），其中最长scaffold为30.07 Mb，N50长度为13.5 Mb，其连续性对比已发表版本提升显著。新版本基于通用单拷贝直系同源基因（BUSCO）的基因组完整性评估指标达96.5%。白符䖴新版本的基因组组装为后续的基因组注释以及六足动物的进化、土壤生态毒理学提供了丰富的基础资料。

原文链接：http://www.jxszl.com/nongxue/zwbh/607354.html