目录
摘 要 II
关键词 II
ABSTRACT II
KEY WORDS II
正文 II
1 材料与方法 1
1．1 测序数据 1
2 数据的处理与分析 1
2．1 系统、软件及数据库 1
2．1．1 系统 1
2．1．2 软件 1
2．1．3 数据库 1
2．2 基因组评估 2
2．3 基因组注释 2
2．3．1 基因组结构注释 2
2．3．2 基因组功能注释 2
2．4 基因家族进化 3
3 结果与分析 3
3．1 基因组评估 3
3．2 基因组注释 4
3．2．1 重复序列注释 4
3．2．2 蛋白编码基因注释 4
3．2．3 非编码RNA注释 4
3．3 基因家族进化 5
4 讨论 6
致谢 7
参考文献： 7
表1白符䖴（Folsomia candida）组装版本的比较 10
土壤模式动物白符䖴（Folsomia candida）
基因组的注释
摘 要
白符䖴（Folsomia candida）属于土壤低等六足动物，因其分布范围广、生长周期短、孤雌生殖、繁殖率高等特点，长久以来一直是土壤生态学和环境毒理学研究的主要模式动物之一。该种已发表基因组注释的基因集完整性评估仅为79.4%，为了提升基因组注释的完整性，本研究利用高质量的基因组组装结果进行重新注释注释。MAKER注释流程预测了20080个蛋白质编码基因，其中80.56%和96%的基因获得转录组和UniProt蛋白质等数据支持，基因集完整性为92.4%，远超已发表版本。此外，结构注释鉴定了253665条（22.3%）重复序列和661个非编码RNA。基因家族进化分析鉴定了8876个基因家族，其中48个家族发表生了快速进化（扩张或收缩）事件。白符䖴新版本的基因组注释将为六足动物的进化、土壤生态毒理学提供重要 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: *351916072* 
的基础资料和新视角。

原文链接：http://www.jxszl.com/nongxue/zwbh/607353.html