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胡萝卜abf和nac转录因子鉴定及其对非生物胁迫响应分析【字数:11906】

2024-11-03 13:05编辑: www.jxszl.com景先生毕设

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缩 略 词 表 III
第一章 胡萝卜ABF转录因子基因DcABF1的克隆与非生物胁迫应答分析 1
1、材料与方法 1
1.1 实验材料 1
1.2 方法 2
1.2.1 cDNA的合成 2
1.2.2 胡萝卜DcABF1基因克隆 2
1.2.3 序列分析 2
1.2.4 实时定量PCR反应 3
2、实验结果 3
2.1 胡萝卜ABF转录因子基因DcABF1的克隆及序列分析 3
2.2 ABF转录因子的序列比对分析 3
2.3 胡萝卜DcABF1转录因子系统进化分析 5
2.4 胡萝卜DcABF1转录因子氨基酸序列的理化性质分析 6
2.5 胡萝卜DcABF1转录因子蛋白的亲/疏水性分析及无序化结构分析 7
2.6 胡萝卜DcABF转录因子蛋白的二级结构和三级结构预测与分析 7
2.7 胡萝卜DcABF转录因子蛋白的结构域分析 9
2.8 胡萝卜DcABF启动子分析 9
2.9 胡萝卜DcABF基因对非生物胁迫的响应 10
3、讨论 11
第二章 基因组和转录组分析胡萝卜NAC家族转录因子及对非生物胁迫的响应 13
1、材料与方法 14
1.1 植物材料、生长条件和非生物胁迫处理 14
1.2 胡萝卜和拟南芥数据库的来源 14
1.3 系统发育树构建、序列比对和数字表达谱 15
1.4 RNA分离和cDNA反转录 15
1.5 RTqPCR分析 15
1.6 数据分析 16
2、实验结果 16
2.1 胡萝卜中NAC家族转录因子的鉴定 16
2.2 系统发育和进化分析 18
2.3 DcNAC的保守结构域分析 21
2.4 胡萝卜与拟南芥NACs相互作用网络 23
2.5 胡萝卜根系发育过程中DcNAC基因表达谱分 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ^351916072
析 23
2.6 非生物胁迫处理下DcNAC基因的表达分析 25
2.6.1低温处理 25
2.6.2 高温处理 26
2.6.3干旱处理 27
2.6.4盐处理 27
3、讨论 27
4、总结 30
参考文献 31
附 录 37
本科毕业论文发表的相关学术论文 114
致 谢 115
缩 略 词 表
Abbreviations
缩写
Abbreviation
英文全称
English name
中文全称
Chinese name
AREBs
ABAresponsive elementbinding proteins
脱落酸响应元件结合蛋白
cDNA
complementary DNA
互补 DNA
DAS
days after sowing
播种后天数
DBD
DNAbinding domain
DNA结合域
DREBs
dehydrationresponsive elementbinding proteins
干旱应答元件结合蛋白
MW
molecular weight
分子量
NACRS
NAC Recognition Sequence
NAC识别序列
ORFs
open reading frames
开放性阅读框
PCR
polymerase chain reaction
聚合酶链式反应
pI
isoelectric point
等电点
RD
responsive to dehydration
脱水反应
RPKM
reads per kilobase per million mapped reads
每百万reads中来自于某基因每千碱基长度的reads数
RTqPCR
realtime quantitative PCR
实时荧光定量聚合酶链式反应
SMS
sequence manipulation suite
序列处理套件
TF
transcription factor

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