基于线粒体cytb基因的长江刀鲚群体遗传结构分析【字数:8299】
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言 3
1 材料与方法4
1.1 实验材料 4
1.2 基因组DNA的提取4
1.3 DNA检测4
1.4 PCR扩增与测序5
1.5 数据处理与分析5
2 结果与分析5
2.1 刀鲚群体遗传多样性5
2.2 刀鲚群体遗传结构 6
2.3 刀鲚群体历史动态 8
3 讨论 8
3.1 刀鲚群体遗传多样性及历史动态分析 8
3.2 刀鲚群体遗传分化程度分析9
3.3 刀鲚群体系统进化树及中性检验分析9
参考文献10
致谢10
附录10
本科期间学术成果10
基于线粒体Cyt b基因的长江刀鲚群体遗传结构分析
摘 要
基于线粒体Cyt b基因,通过PCR扩增技术对4个不同区段的长江刀鲚群体进行遗传结构分析,共采集分析长江刀鲚160尾,共检测出34个变异位点,31个单倍型。本研究中刀鲚群体单倍型多样性(H d=0.49)接近临界水平(0.5),核苷酸多样性水平(π =0.00078)低于临界水平(0.005),雌性群体的遗传多样性水平明显高于雄性群体。本研究中长江刀鲚群体间遗传距离较小,分化程度较低。进一步分析变异组成显示:长江刀鲚群体的变异来源主要来自于群体内,群体间变异不显著,说明长江刀鲚在遗传学上仍为一个分类单元,不存在明显的遗传分化。推测是开放的水域特征及栖息环境导致长江刀鲚群体间基因交流频繁。中性检验结果显示长江刀鲚群体积累了较多的低频突变,DNA进化偏离中性选择,在历史上可能发生过历史扩张事件。基于单倍型构建的系统进化树显示31个单倍型聚为2支,单倍型Hap1Hap13、Hap15Hap25、Hap27Hap31聚为一支(n=158),单倍型Hap14和Hap26聚为另一支(n=2)。推测长江刀鲚极少数个体可能发生了基因突变或是长江刀鲚的淡水定居型个体。
原文链接:http://www.jxszl.com/nongxue/scyz/606704.html