目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1 材料与方法2
1.1 数据来源 2
1.2 原始数据的质量评估与预处理3
1.3 测序数据与参考基因组的比对3
1.4 修饰富集区间的分析4
1.4.1富集区间的鉴定4
1.4.2 富集区间交集的获取4
1.4.3 富集区间的注释4
1.5 基因表达分析5
1.6 基因富集分析5
2 结果与分析5
2.1 数据质量的控制5
2.1.1 测序数据的质量5
2.1.2 测序数据回帖的质量7
2.2 数据重复性的检验8
2.3 RNA m6A修饰与组蛋白修饰的关联性9
2.3.1 两类修饰的重叠性9
2.3.2 两类修饰的分布特征10
2.3.3 两类修饰与基因表达水平的关系11
2.3.4 两类修饰基因的功能注释12
3 讨论 14
致谢15
参考文献15
RNA m6A修饰与组蛋白修饰的关联分析
摘 要
RNA上存在多种化学修饰，其中6甲基腺嘌呤（m6A）是分布最广、研究最多的修饰之一，在真核生物中具有调节RNA剪接、出核、翻译、降解的功能。染色质核小体区域的组蛋白上可以发生甲基化、乙酰化、泛素化、磷酸化等类型的翻译后修饰，并以不同的作用机制参与转录调控、DNA复制与损伤修复等过程。本文运用生物信息学方法处理拟南芥的RNA m6A与组蛋白H3K36me3修饰高通量测序数据，从重叠性、分布特征、基因表达水平、基因功能注释等方面解析两类修饰的关联性。结果显示，在富集区间上，两修饰所在区间存在1930个交集，约达35.0%的m6A修饰对应区间富集着H3K36me3；在基因组分上，m6A与H3K36me3有各自的位置偏好性，也具有分布于基因体区域的共同特征；通过基因表达分析，发现部分位点上H3K36me3的富集程度与转录本水平呈正比，而一些m6A的分布位点则 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ￥351916072$ 
存在此二者的反比关系；GO分析表明两类修饰与核糖体、叶绿体等细胞元件以及翻译、剪接等生物学过程存在紧密的联系。本研究为深入阐释RNA m6A修饰和组蛋白修饰的关系奠定了基础。

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