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水稻粒长和粒宽的qtl定位【字数:7024】

2024-02-24 16:50编辑: www.jxszl.com景先生毕设
粒长和粒宽是影响水稻产量的两个重要性状。为解析水稻粒长和粒宽的遗传基础,利用目标性状差异明显的粳稻品种茭白稻和籼稻品种Saber构建的F2群体,进行水稻粒长和粒宽的QTL分析。共检测到1个粒长位点qGL7和2个粒宽位点qGW5-1、qGW5-2,分布于水稻第7和第5号染色体上。其中位于7号染色体上RM11至RM1084标记之间的粒长QTL,LOD值为5.3152,贡献率17.8416%;位于5号染色体RM7302至RM4915标记之间的粒宽qGW5-1,LOD值分别为3.208,贡献率为11.3565%;尚未被报道,可能是新的QTL位点。位于5号染色体RM4674至L75标记之间的QTL,LOD值为2.9911,贡献率为28.545%。
目录
摘要2
关键词2
Abstract2
Key words2
引言2
1材料与方法5
1.1亲本材料及群体构建 5
1.2田间种植和表型鉴定5
1.3基因分析5
1.3.1 DNA提取5
1.3.2 PCR及电泳检测5
1.4 F2群体遗传图谱构建和QTL定位5
2 结果与分析6
2.1亲本与F2群体粒长的表型特征6
2.2 F2群体粒长和粒宽性状的QTL定位结果6
3讨论7
3.1 QTL定位方法特点7
3.2 粒长粒宽QTL定位结果比较7
3.3 QTL的多效性8
致谢8
参考文献9
水稻粒长和粒宽的QTL定位
引言
引言
水稻是重要的粮食作物,水稻产量的主要构成因素就是粒重,受籽粒长宽厚等因素的影响。因此,粒重研究具有重要育种利用价值[1,2]。在过去几年里,对基因的定位及其分子机制都有较为深入的研究报道,给分子辅助育种奠定了良好的理论基础。粒形相关的QTL研究报道很多,一些相关基因被成功克隆出来(表1)。如GS3[5],GW2[6],GW8[7], qGL3[8],TGW6[9]等。
表1.水稻籽粒相关研究报道
基因位点
 *51今日免费论文网|www.jxszl.com +Q: ^351916072
Gene locus
性状
Trait
染色体
Chr.
功能
Function
参考文献
Reference
GS9
粒长
9
编码一个未知表达蛋白
[10] (Liu et al 2018)
GW8
大小和形状
8
编码一个转录因子
[7] (Wang et al 2012)
qGL3
粒型/产量
3
编码蛋白磷酸酶
[8] (Zhang et al 2012)
GS3
粒宽/粒重
3
编码假定跨膜蛋白
[5](Fan C, et al 2006)
qSW5/GW5
粒宽/粒重
5
编码钙调素结合蛋白
[11] (Liu et al 2017)
PGL1
粒长
3
形成异源二聚体结合DNA的bHLH抑制子
[12] (Heang and Sassa 2012)
PGL2
粒长
2
形成异源二聚体结合DNA的bHLH抑制子
[12] (Heang and Sassa 2012)
GL7/GW7
粒长/粒宽
7
编码拟南芥LONGIFOLIA蛋白的同源蛋白/
基因编码一个TONNEAU1募集基序蛋白
[13] (Wang et al. 2015)
(Wang et al. 2015)
GW2
粒宽/粒重
2
编码环形E3泛素连接酶
[14] (Song et al. 2007)
GW6
粒重
6
编码一个拥有乙酰转移酶的类GNAT蛋白
[15] (Song et al. 2015)
TGW6
粒重
6
编码IAA葡萄糖水解酶
[16] (Ishimaru et al. 2013)
HGW
粒重
6
编码泛素结构域蛋白
[17] (Li et al. 2012)
近期定位到了能够控制水稻粒形的新基因GS9,位于水稻第9染色体上。GS9具有独立的表达机制,完全不同于GW5和GL7等基因调控粒形的效应,而且和其它的粒形基因互不干扰。gs9是GS9的功能缺失突变体,可以在不影响植株发育成长的情况下使籽粒变得细长。相比较之下,这种细长的粒形中垩白明显少于其它粒形。在发育的幼穗中,GS9蛋白的C端具有活性,蛋白缺失或变性,这种活性就会丧失,不能进行转录。颖壳细胞的分裂是通过GS9是先与OFP8或OFP14互作产生转录复合体,再经过GSK2的磷酸化调控,共同来控制的。目前,在所有的水稻品种中,还没有发现GS9的功能缺失突变体,说明gs9在育种上还没有研究应用[10]。
GW5被定位于位于第5染色体上,值得一提的是,这个基因能够稳定遗传。分析比较之后发现了有1212bp片段缺失的GW5,将GW5的缺失型和常规水稻品种基因型进行对比分析,发现它是主要调控粒宽和粒重的主效基因。该基因水稻的各个器官中都有表达,但在幼穗中的表达水平最高。编码钙调素结合蛋白,是油菜素内酯信号传导的正向调节因子。GW5抑制GSK2的自磷酸化以及GSK2对OsBZR1和DLT的磷酸化,影响细胞核中未磷酸化的OsBZR1和DLT蛋白的积累,从而调节油菜素内酯响应基因的表达水平和生长响应,包括粒宽和粒重。

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