目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言2
1材料与方法2
1.1试验材料2
1.2 试验方法2
1.2.1 TIANGEN试剂盒法提取DNA3
1.2.2 目标位点引物的设计3
1.2.3 目的片段PCR扩增条件的摸索3
1.2.4 目的片段PCR扩增4
1.2.5 对目的片段进行DNA测序4
1.2.6 DNA测序结果与产仔数关联性分析4
1.2.7 目的标记附近基因查找5
2结果与分析5
2.1 测序结果5
2.2 结果分析5
2.2.1 rs81447100位点多态性分布5
2.2.2 rs81447100位点基因型与总产仔数估计育种值的关联性分析5
2.2.3 rs81447100位点基因型与产仔数的关联性分析6
2.2.4 目的标记附近基因查找结果6
3讨论 7
3．1 rs81447100位点及其附近相关基因的研究报道7
3．2 rs81447100位点对苏淮猪繁殖性能的影响7
3．3 扩大群体进一步验证该位点的可靠性8
4总结 8
致谢8
参考文献8
图1 4
图2 5
图3 6
表1 5
表2 6
表3 6
猪SNP位点rs81447100多态性与苏淮猪产仔数的关联性分析
引言
苏淮猪作为培育猪种，大约克猪血统占75 %，淮猪血统占25 %，结合了淮猪的繁殖性能和大约克猪的生长性能优势，是非常优良的培育猪种[1]。近年来统计发现该群体内产仔数变异较大。产仔数是最能代表猪群繁殖力水平的一项指标，也是给养殖 *景先生毕设|www.jxszl.com +Q: *351916072* 
者带来经济效益的关键。猪的繁殖性状主要包括产活仔数（Number born alive, NBA）、总产仔数（Total number born, TNB）、初生重（Born weight, BW）、初生窝重（Litter born weight, LBW）和断奶窝重（Litter weaning weight, LWW）等，其中最重要的指标是TNB和NBA。因此，加强TNB和NBA的选择，对提高苏淮猪的繁殖力至关重要[2]。
影响母猪繁殖力的因素有很多，母猪本身的遗传基础仍是其中最主要的一个因素[3]。产仔数的遗传力低，且受复杂多基因控制，应用传统选育技术难以较快提高这一性状的遗传进展[4]。分子生物技术的发展，主基因（major gene）和数量性状座位（quantitative trait locus, QTL）的提出，再结合分子遗传标记技术，便可研究控制数量性状的基因的作用、传递方式及其在染色体上的位置，对目的基因的基因型进行选择，使选育工作更加高效[5]。
全基因组关联分析(Genomewide association study, GWAS)是一种通过对全基因组范围内的遗传标记(如SNP)进行检测来研究动物某一性状遗传的方法。QTL中某一特定核苷酸的改变往往伴随着个体表型的改变，这个特定核苷酸被称为数量性状核苷酸(Quantitative trait nucleotide, QTN)。也就是说，QTL能够影响性状正是因为QTN发生了改变[6]，GWAS就是通过对全基因组范围内的遗传标记进行检测，以期寻找到那些能够影响性状的QTN的一种方法。
因此，研究并应用分子标记技术对高产相关基因开展标记辅助选择，对提高猪的繁殖力水平具有重要的意义。
目前，有很多关于候选基因与产仔数的研究，已经报道的候选基因有卵泡刺激素β亚基基因、抑制素A基因5UTR区、催乳素受体基因、雌激素受体基因和视黄醇结合蛋白4（RetinolBinding Protein 4, RBP4）基因[7~11]等。这些候选基因可以不同程度地影响猪的产仔数，但在不同的群体中所表现出的作用却不尽相同。
1 材料与方法
1．1 试验材料
本研究中使用的313头经产苏淮母猪的耳样全部来自淮阴种猪场，具有系谱信息及繁殖记录。用耳号钳采集耳组织样并将采集到的耳样保存于含75%酒精的离心管内，与冰袋一同放置在保温箱中，及时从养殖场运送回实验室，之后置于20℃冰箱内保存备用。
提取耳组织样品DNA的试剂盒（TIANGEN试剂盒）采购于天根生化科技（北京）有限公司，试验中使用的Mix来自南京擎科公司，PCR反应引物由南京擎科公司负责合成。其他试验器材由本实验室自备。
1．2 试验方法
1．2．1 TIANGEN试剂盒法提取DNA
1．2．1．1  材料的处理：从大块耳样上剪取试剂盒使用说明上所推荐的质量（动物组织约30 mg），然后将获得的小块耳样组织尽量碎块化处理为细胞悬液，设定离心机转速为10000 rpm并将装有细胞悬液的离心管离心1 min，倒净上清液，加200 μl缓冲液GA于离心管内，振荡使内容物完全悬浮。

原文链接：http://www.jxszl.com/yxlw/dwyx/562401.html