猪肠道菌群节律与营养底物关联分析【字数:13166】
目录
摘 要 Ⅰ
ABSTRACT Ⅱ
第一章 文献综述 1
1 肠道菌群的昼夜节律性 1
1.1 肠道菌群构成数量的昼夜节律性 1
1.2 肠道菌群定植的昼夜节律性 1
1.3 肠道菌群功能活动的昼夜节律性 2
2 影响肠道菌群节律的主要因素 2
2.1 饲粮结构影响肠道菌群节律性 2
2.2 宿主进食节律影响肠道菌群节律性 2
2.3 性别影响肠道菌群节律性 3
3 肠道菌群对宿主健康及养分代谢的影响 3
3.1 肠道菌群对宿主生物钟的调控作用 3
3.2 肠道菌群对养分代谢的影响 3
4 不同营养底物对肠道菌群的调控作用 4
4.1 日粮碳水化合物对猪肠微生物的影响 4
4.2 蛋白质对猪肠微生物的影响 4
4.3 脂肪对猪肠道微生物的影响 5
第二章 实验材料与方法 6
1 实验材料与实验方案 6
2 指标测定 6
2.1 肠道菌群DNA提取实验材料 6
2.2 宏基因组测序 6
2.3 测序数据分析实验材料 7
2.4 代谢组学及数据分析 7
第三章 实验结果 8
1 细菌节律性 8
2 代谢节律性 16
3 营养底物与菌群节律的关联性 19
第四章 分析与讨论 21
1 细菌节律性 21
2 代谢节律性 21
3 营养底物与菌群节律的关联性 22
第五章 结论与展望 23
1 结论 23
2 意义与展望 23
参考文献 24
致 谢 26
猪肠道菌群节律与营养底物关联分析
摘 要
动物肠道菌群在结构和功能层面存在节律性变化,且这种变化受宿主采食时间的影响,本文主要目的是研究猪肠道菌群节律与营养底物的关联性,探究肠道内营养底物如何影响肠道菌群节律。 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ¥351916072¥
选用体重相近的生长期三元杂交阉公猪8头(体重约15kg),手术安装结肠瘘管(结肠近端)恢复后,饲喂商品生长猪日粮,正式试验期间自由采食、饮水。饲喂7d后,每隔3h采集结肠食糜一次(分别为06:00、09:00、12:00、15:00、18:00、21:00、24:00;03:00、06:00),采集的食糜迅速放于80℃保存,用于宏基因组测序和代谢组学分析。结果表明,猪结肠厚壁菌门(P Adj = 1.77 × 10 5)、拟杆菌(P Adj = 1.77 × 10 5)、变形菌门(P Adj = 1.97 × 10 5)、放线菌门(P Adj = 0.017)的相对丰度具有节律性。LCMS代谢组学分析共得到454个代谢物,这些代谢物主要来自于属于氨基酸类及其衍生物、有机酸、肽类、胺类、其他、类固醇、脂质、脂肪酸、糖类及其衍生物、黄酮类等37类物质。通过JTK分析可知其中296个具有节律性,占比65.20%。关联分析结果表明结肠食糜中具有节律性的微生物与具有节律性的代谢物之间存在广泛的相关关系,特别的普氏菌与烟酸单核苷酸(r = 0.94, P < 0.001)、8iso15ketoPGF2a(r = 0.91, P < 0.001)、己基甘氨酸(r = 1.00,P < 0.001)、N癸酰甘氨酸(r = 0.97, P < 0.001)、焦谷氨酸(r = 0.94,P < 0.001)、戊基天冬氨酸(r = 0.93, P < 0.001)呈显著正相关关系,与N乙酰b氨基葡萄糖胺(r = 0.94, P < 0.001)、甲基β半乳吡喃苷(r = 0.91, P < 0.001)、N乙酰天冬酰胺(r = 0.96, P < 0.001)、缬氨酸(r = 0.94, P < 0.001)、γ谷氨酰谷氨酰胺(r = 0.97, P < 0.001)、亮氨酸(r = 0.94, P < 0.001)、γ谷氨酰丝氨酸(r = 0.97,P < 0.001)呈显著负相关关系。通过以上结果可知:生长猪肠道中特定菌群及代谢物具有节律性,其中具有节律性的代谢物比例高于肠道微生物。且具有节律性的肠道菌群与结肠中节律性变化的代谢物存在关联性。
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