目录
摘 要 I
ABSTRACT II
第一章 文献综述 1
1 中国牛品种资源现状简述 1
1.1 我国牛品种简介 1
1.1.1 地方品种 1
1.1.2 引进品种 2
1.1.3 培育品种 2
1.2 我国牛品种资源问题 3
1.3 牛品种资源问题的解决 4
2 DNA条形码概述 4
2.1 DNA条形码的概念 4
2.2 DNA条形码国内研究进展 4
2.3 DNA条形码国外研究进展 5
2.4 DNA条形码的特点 5
3 DNA条形码技术在畜牧中的应用 6
3.1 遗传资源鉴定 6
3.2 疫病防控 6
3.3 肉制品鉴定 6
3.4 野生动物保护 6
4 小结 7
第二章 中国牛品种DNA条形码的获取 8
1 材料与方法 8
1.1 材料 8
1.1.1 样品采集与保存 8
1.1.1.1 冷冻精液 9
1.1.1.2 血液样品 9
1.1.1.3 毛发样品 9
1.2 基因组DNA的提取 9
1.2.1 冷冻精液DNA的提取 9
1.2.2 血液DNA的提取 9
1.2.3 毛发DNA的提取 10
1.3 PCR扩增 10
1.4 TA克隆 10
1.5 Sanger测序 10
2 结果与分析 10
2.1 DNA提取结果 10
2.2 PCR产物检测 11
3 讨论 12
第三章 中国牛品种DNA条形码的分析 13
1 材料与方法 13
1.1 DNA序列的处理 13
1.2 BLAST 13
1.3 Dna SP 软件分析 13
1.4 MEGA X 软件分析 13
2 结果与分析 13 *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: ^351916072^ 

2.1 基因序列的种间遗传信息 13
2.2 碱基组成含量分析 15
2.3 物种分辨率分析 16
2.4 系统发育树分析 17
2.4.1 COI条形码系统发育树 17
2.4.2 Cytb条形码系统发育树 19
2.4.3 Dloop条形码系统发育树 20
3 讨论 20
3.1 遗传多样性分析 20
3.2 系统发育分析 21
第四章 结论与展望 22
1 全文结论 22
2 工作展望 22
参考文献 23
致 谢 27
中国牛品种的DNA条形码技术
摘 要
我国是世界上牛品种遗传资源较为丰富的国家之一，保护牛品种遗传资源关系到养牛业的可持续发展。DNA条形码技术作为一种能快速准确的鉴定物种的工具，是未来物种的鉴定与分类发展的主要方向之一。本课题在实验团队提供的DNA条形码数据的基础上，对我国3个本地品种、3个培育品种和3个引进品种共63个个体的COI、Cytb和Dloop条形码序列进行分析，以期将DNA条形码技术用于牛品种溯源和鉴定，为研究各品种间的演化及亲缘关系提供参考借鉴。
本课题得出以下结论。
一、本地品种的单倍型在三类牛中所占各基因型全部序列的比例最低，分别为COI 43.15%、Cytb 31.99%和Dloop 36.67%。各牛品种内有着重复的条形码序列，存在着共享序列的情况。引进品种在COI及Cytb条形码中，各项参数数值都较高，相较其他两类牛品种而言，遗传多样性更丰富。
二、碱基组成分析表明，本课题所研究的牛种的A+T平均含量在54.40%~60.00%之间，C+G平均含量在40.00%~45.70%之间，A/T含量显著高于G/C含量，具有明显的AT偏好和反G偏倚的特点。
三、从核苷酸序列来看，Dloop条形码的物种分辨率优于COI和Cytb，更适合用于物种鉴别；且这三种基因对于我国的本地品种的鉴别更有效。
四、从系统发育分析层面来看，基于COI基因构建的系统进化树相比起其他两种基因更适合于牛品种的分类，且可用于本地品种的溯源，这有助于保护我国地方牛种质资源。

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