茶树金属转运蛋白hma家族基因的筛选克隆与鉴定【字数:13998】
目录
摘 要 I
ABSTRACT II
第一章 文献综述 1
1 茶树重金属污染研究 1
1.1 茶树重金属污染现状 1
1.2 茶树体内重金属元素富集的危害 1
1.3 金属化学物质来源 2
1.4 重金属检测技术 3
2 P1B型重金属转运ATP酶 3
2.1 P1BATPase的结构特征 4
2.2 P1BATPase的分类 4
2.3 P1BATPase生物学功能 5
3 研究目的和意义 6
4 研究思路和技术路线 6
4.1 研究思路 6
4.2 技术路线 6
第二章 茶树HMA家族基因的生物信息学分析 8
1 材料与方法 8
1.1 茶树HMA家族基因的筛选 8
1.2 茶树HMA家族基因的生物信息学分析 8
2 结果与分析 9
2.1 茶树HMA家族基因鉴定 9
2.2 茶树HMA家族命名与分类 9
2.3 茶树HMA家族理化性质、蛋白质二级结构预测 10
2.4 茶树HMA家族的基因结构和蛋白结构分析 12
3 讨论 15
第三章 茶树CsHMA家族基因的克隆 17
1 材料与方法 17
1.1 试验材料 17
1.2 试验试剂 17
1.3 试验仪器 17
1.4 试验方法 17
2 结果与分析 19
2.1 总RNA浓度 19
2.2 cDNA检测 20
2.3 CsHMA9基因扩增 20
2.4 菌液PCR检测 20
3 讨论 21
第四章 结论与展望 23
1 结论 23
2 展望 23
致 谢 26
茶树金属转运蛋白HMA家族基因的筛选、克隆与鉴定
摘 要
茶树(Camellia sinens *51今日免费论文网|www.51jrft.com +Q: #351916072#
is (L.) O. Kuntze)是我国重要的经济作物之一,重金属是其面临的重要环境胁迫之一。P1B型重金属转运ATP酶(HMA)在植物的重金属胁迫中起重要作用,但其在茶树中的研究比较少。本文对茶树CsHMA家族基因的理化性质、结构特点等进行生物信息学分析,克隆获得茶树的HMA基因CsHMA9,并对其在重金属胁迫中的作用及其机制进行了初步探究。所得研究结果如下:筛选出24个茶树CsHMA基因,利用 MEGA7.0将HMA家族基因的氨基酸序列与其他物种的氨基酸序列进行同源性分析发现,茶树HMA家族基因与水稻及拟南芥的亲缘关系很近。利用SOPMA对HMA蛋白质二级结构预测显示,24个茶树HMA蛋白二级结构均包含α螺旋、β折叠、延伸链和无规则
卷曲。克隆得到的茶树CsHMA9基因全长为2964 bp,编码氨基酸数为987。其所编码的蛋白质相对分子量为108022.35,等电点(PI)为6.18,不稳定参数为33.22,属于稳定蛋白;平均亲水系数为0.106,定位于质膜上,有8个跨膜蛋白。
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