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摘 要 Ⅰ
ABSTRACT Ⅱ
第一章 文献综述 1
1 抑病型与导病型土壤 1
1.1 抑病型土壤与导病型土壤 1
1.2 抑病型土壤机制 1
2 抗生素抗性基因污染及研究现状 1
2.1 抗生素抗性基因污染 1
2.2 畜牧业中抗生素抗性基因研究现状 1
2.3 农业中抗生素抗性基因研究现状 2
2.3 农业中抗生素抗性基因研究现状 2
3 土壤致病菌污染及研究现状 2
3.1 土壤致病菌污染 2
3.2 土壤致病菌研究现状 2
3.3 土壤和根际对土壤致病菌的作用 3
4 土壤致病菌和ARGs的交互作用 3
4.1 二者交互作用研究现状 3
4.2 二者交互作用研究缺陷 3
5 研究目的与意义 3
6 主要研究内容和技术路线 4
6.1 主要研究内容 4
6.2 技术路线 4
第二章 实验设计与结果讨论 5
1 材料与方法 5
1.1 样品采集 5
1.1.1 采样地点基本信息 5
1.1.2 土样采集方法 5
1.2实验方法 6
1.2.1土壤DNA提取 6
1.2.2土壤宏基因组测序文库的构建与测定 6
1.2.3宏基因组下机数据处理 6
1.2.4宏基因组数据的基因预测与注释 6
1.2.5统计与分析 7
2 结果与分析 7
2.1 宏基因组数据概况 7
2.2 不同处理对土壤微生物组及抗生素抗性组主成分的影响 9
2.3 不同处理对土壤微生物组组成的影响 9
2.4 不同处理对土壤抗生素抗性组组成的影响 11
2.5 土壤抗生素抗性组与微生物组成的相关性 15
第三章 结论与展望 18
参考文献 21
致 谢 26
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组与抗性基因组的特征研究
摘 要
土传病原菌与抗生素抗性基因组相复合的污染是值得重点关注的一种土壤生物复合污染。在能抑制土传枯萎病发生的蕉园土壤中，其微生物组成与抗生素抗性基因组特征如何仍不清楚。本研究分别从抑病及导病型蕉园采集土壤及根际样品，利用土壤宏基因组测序技术，分析比较了抑病和导病型蕉园香蕉土体、根际土壤微生物及抗生素抗性基因的组成与功能差异。结果表明：抑病型蕉园土体及根际土壤微生物及抗生素抗性基因组成均显著区分于导病型蕉园处理。在微生物组成方面，抑病型土体及根际土壤在门水平上富集了拟杆菌门及芽单胞菌门，在属水平上富集了厌氧粘细菌属、粘杆菌属及粘球菌属。在抗性基因组成方面，根际土壤中富集了更多的抗生素抗性基因种类；与导病型处理相比，抑病型蕉园根际土壤富集了19个抗生素抗性基因，而降低了8个抗生素抗性基因。Mantel相关性分析结果表明，抗生素抗性基因组与微生物组之间显著相关；Spearman相关性分析结果表明，抗性基因amrb、aph3ia、arna与拟杆菌门均呈显著负相关关系。研究结果表明，根际微生物的富集确能导致抗生素抗性基因的富集，但在病害发生与调控过程中，不同种群与抗生素抗性基因的关系不尽相同仍需深入探究。
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