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竺山湾湖滨缓冲带底泥微生物群落结构研究

2021-03-07 15:47编辑: www.jxszl.com景先生毕设
本研究调查了宜兴周铁镇10条支浜表层底泥中的微生物含量,按照污染源类型,将10个采样点分为农村生活污染源(S1、S2、S3、S4)、畜禽养殖业污染源(S5、S6、S7)和种植业污染源(S8、S9、S10),并将底泥中微生物16S rDNA与重金属含量和基本物理指标进行对比。分析结果表明,畜禽养殖污染源底泥中微生物含量最高,种植业污染源底泥中微生物含量最低。底泥微生物16S rDNA的拷贝数与总磷总镍在0.05水平上呈显著负相关,与总汞在0.01水平上呈显著正相关;与总氮、总钾、铅、镉、铬、砷、铜之间相关性不显著。
目录
摘要 1
关键词 1
引言 1
1 材料与方法 2
1.1采样点概况 2
1.2 样品采集 3
1.3 材料 4
1.4 荧光定量PCR原理 4
1.5 方法 4
1.5.1 DNA提取方法 4
1.5.2 质粒标准品的制备 4
1.5.3 标准曲线建立 5
1.5.4 荧光定量PCR 5
1.5.5 底泥重金属测定方法 5
1.6 数据处理方法 5
2. 结果与分析 6
2.1 荧光定量PCR 6
2.2底泥微生物16S rDNA及几种常见重金属、总N、总P、有机质含量及pH 8
3 讨论 10
致谢 10
参考文献: 11
竺山湾湖滨缓冲带底泥微生物群落结构研究
引言
微生物对维持整个生态系统稳定具有重要的作用,它们是自然界的初级生产者和分解者。底泥微生物是指湖泊等水体的底泥(沉积物)中一切看不见或者看不清楚的微小生物的总称,严格意义上包括细菌、古菌、真菌、病毒、原生动物和显微藻类。湖泊底泥是一个微生物种类丰富、物质交换频繁、生物活性高的特殊环境。底泥微生物是湖泊生态系统物质循环和污染物质降解的主要动力,在湖泊生态系统中起着特别重要的作用。如碳循环(纤维素及有机物分解作用)、氮循环(硝化、反硝化作用)、腐殖质分解和合成作用,磷、硫等其他元素的价态转化等。
沉积物微
 

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生物多样性的研究,是微生物分子生态学研究中一个重要内容。分子生态学研究方法的不断发展为其提供了有力手段,但由于每种方法各有利弊,目前对沉积物中微生物多样性的考察一般需要综合运用其中的几种方法,已经有应用不同方法综合研究多种类型沉积物的报道。Ravenschlag等[1]使用特异探针杂交和16S rDNA文库ARDRA方法,鉴定了连续低温海洋沉积物的细菌多样性,表明在只有2. 6e左右的海洋沉积物中仍然存在高度多样性的细菌群落。Bowman[2]于2003年使用16S rDNA文库方法,研究了南极大陆架不同深度沉积物中原核生物的多样性,得出沉积物中微生物物种丰度随着沉积物深度增加而下降的结论,而且鉴定出大部分生物类型在海洋沉积物中具有普遍存在性。Buhring等[3]于2005年运用FISH和脂肪酸分析方法,对通透性沙土沉积物中的微生物群落结构进行了研究,表明硫酸盐还原菌群在有氧海洋沉积物中也具有很重要的作用,并且证明,脂肪酸这种生物标记(biomarker)和FISH方法的综合运用能够有效地探测沉积物中微生物的群落结构。Chan等[4]使用DGGE方法研究了人工酸性沼泽湖中产甲烷古菌的群落特征,表明其中产甲烷古菌类群的多样性有限,而且其多样性高低与产甲烷速率成正相关。Wobus等[5]综合使用FISH、16S rDNA克隆文库和胞外酶测定的方法,考察了不同营养化程度的水库沉积物中的微生物多样性,得出B变形杆菌更多地存在于营养化程度较高的水库沉积物中,而C变形杆菌则与之相反;且胞外酶测定结果显示,不同营养化的水库沉积物有其特异的代谢模式。使用16S rDNA文库方法鉴定了官厅水库不同深度沉积物的细菌群落分布特征,结果显示,不同深度沉积物中微生物的多样性有显著差异,且其多样性分布与沉积物的理化特征分布呈现明显的相关性[6]。
1 材料与方法
1.1采样点概况
本次实验的10个采样点位于江苏省无锡市宜兴周铁镇的10条支浜,其中受农村生活污染源影响的4个采样点分别为北准桥采样点(S1)、赵渎桥采样点(S2)、葛渎桥采样点(S3)和埝下桥采样点(S4),受家畜养殖业污染源影响的3个采样点分别为陈家组采样点(S5)、钱家浜采样点(S6)和长沟槽采样点(S7),受种植业污染源影响4个采样点分别是徐渎桥采样点(S8)、盛渎桥采样点(S9)和花干浜采样点(S10)。各采样点的选择尽量避免污染源交叉情况的出现,采样点水相pH5.54—6.9。各采样点具体情况见表11。
表11. 采样点情况
Tab.11. Sampling point situation
序号
采样点位置
水质直观描述
总体情况
岸坡
动物
周边植被情况
S1
北准桥
黄绿色,少量浮萍和生活垃圾
两岸村庄有生活污水直排,可视深度20cm
破损
家养鸭
原生态当地物种
S2
赵渎桥
黄绿色,浮萍覆盖率30%
两侧农居,西北侧苗圃。浜内有野生鱼。木桩护岸,出水5cm
轻度破损
野生鱼
原生态当地物种
S3
葛渎桥
黄绿色,少量浮萍,能见度1020cm
两岸农居,北侧建筑垃圾,两岸硬化
两岸硬化处理,未处理处破损
少量野生鱼
原生态当地物种
S4
埝下桥
黄绿色,无漂浮物
两侧农居,有养鸡鸭
北侧破损,南侧有水泥硬化
野生鱼
原生态当地物种
S5
陈家组
深黄绿色,有垃圾漂浮,浮萍覆盖率30%
养猪700头,附近有化工厂污水直排,污染地下水,两侧有生活污水排入
无固化,有破损
水中无动物,两岸养猪
原生态当地物种
S6
钱家浜
黄绿色,有浮床1处漂浮垃圾,浮萍覆盖率40%
两岸农居,养猪150头,岸上有生活垃圾
无固化,轻微破损,无农田
放养 鸡
原生态当地物种

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